Protein–RNA interactions for Protein: Q99JT1

Gatb, Glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit B, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GatbQ99JT1 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GatbQ99JT1 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GatbQ99JT1 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GatbQ99JT1 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
GatbQ99JT1 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GatbQ99JT1 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
GatbQ99JT1 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GatbQ99JT1 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GatbQ99JT1 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GatbQ99JT1 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GatbQ99JT1 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GatbQ99JT1 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GatbQ99JT1 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GatbQ99JT1 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GatbQ99JT1 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GatbQ99JT1 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GatbQ99JT1 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GatbQ99JT1 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GatbQ99JT1 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GatbQ99JT1 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
GatbQ99JT1 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GatbQ99JT1 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GatbQ99JT1 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GatbQ99JT1 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GatbQ99JT1 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GatbQ99JT1 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GatbQ99JT1 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GatbQ99JT1 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GatbQ99JT1 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GatbQ99JT1 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GatbQ99JT1 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GatbQ99JT1 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GatbQ99JT1 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
GatbQ99JT1 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
GatbQ99JT1 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GatbQ99JT1 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GatbQ99JT1 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GatbQ99JT1 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GatbQ99JT1 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GatbQ99JT1 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GatbQ99JT1 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GatbQ99JT1 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GatbQ99JT1 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GatbQ99JT1 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GatbQ99JT1 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
GatbQ99JT1 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GatbQ99JT1 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GatbQ99JT1 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GatbQ99JT1 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GatbQ99JT1 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GatbQ99JT1 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GatbQ99JT1 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GatbQ99JT1 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GatbQ99JT1 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GatbQ99JT1 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GatbQ99JT1 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GatbQ99JT1 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GatbQ99JT1 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GatbQ99JT1 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GatbQ99JT1 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GatbQ99JT1 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GatbQ99JT1 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GatbQ99JT1 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GatbQ99JT1 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GatbQ99JT1 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GatbQ99JT1 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GatbQ99JT1 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GatbQ99JT1 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GatbQ99JT1 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GatbQ99JT1 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GatbQ99JT1 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GatbQ99JT1 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GatbQ99JT1 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
GatbQ99JT1 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GatbQ99JT1 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GatbQ99JT1 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GatbQ99JT1 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GatbQ99JT1 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GatbQ99JT1 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GatbQ99JT1 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GatbQ99JT1 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GatbQ99JT1 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GatbQ99JT1 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GatbQ99JT1 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GatbQ99JT1 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GatbQ99JT1 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
GatbQ99JT1 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GatbQ99JT1 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GatbQ99JT1 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GatbQ99JT1 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GatbQ99JT1 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GatbQ99JT1 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GatbQ99JT1 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GatbQ99JT1 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GatbQ99JT1 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GatbQ99JT1 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GatbQ99JT1 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GatbQ99JT1 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GatbQ99JT1 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GatbQ99JT1 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms