Protein–RNA interactions for Protein: Q91WD4

UPF0415 protein C7orf25 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q91WD4 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Q91WD4 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Q91WD4 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Q91WD4 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Q91WD4 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Q91WD4 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Q91WD4 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Q91WD4 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Q91WD4 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Q91WD4 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Q91WD4 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Q91WD4 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Q91WD4 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Q91WD4 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Q91WD4 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Q91WD4 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Q91WD4 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Q91WD4 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Q91WD4 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Q91WD4 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Q91WD4 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Q91WD4 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Q91WD4 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Q91WD4 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Q91WD4 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Q91WD4 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Q91WD4 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Q91WD4 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Q91WD4 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Q91WD4 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Q91WD4 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Q91WD4 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Q91WD4 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Q91WD4 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Q91WD4 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Q91WD4 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Q91WD4 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Q91WD4 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Q91WD4 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Q91WD4 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Q91WD4 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Q91WD4 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Q91WD4 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Q91WD4 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Q91WD4 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Q91WD4 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Q91WD4 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Q91WD4 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Q91WD4 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Q91WD4 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Q91WD4 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Q91WD4 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Q91WD4 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Q91WD4 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Q91WD4 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Q91WD4 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Q91WD4 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Q91WD4 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Q91WD4 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Q91WD4 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Q91WD4 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Q91WD4 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Q91WD4 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Q91WD4 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Q91WD4 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Q91WD4 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Q91WD4 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Q91WD4 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Q91WD4 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Q91WD4 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Q91WD4 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Q91WD4 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Q91WD4 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Q91WD4 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Q91WD4 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Q91WD4 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Q91WD4 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Q91WD4 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Q91WD4 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Q91WD4 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Q91WD4 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Q91WD4 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Q91WD4 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Q91WD4 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Q91WD4 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Q91WD4 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Q91WD4 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Q91WD4 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Q91WD4 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Q91WD4 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Q91WD4 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Q91WD4 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Q91WD4 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Q91WD4 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Q91WD4 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Q91WD4 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Q91WD4 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Q91WD4 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Q91WD4 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Q91WD4 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms