Protein–RNA interactions for Protein: Q91W40

Klc3, Kinesin light chain 3, mousemouse

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klc3Q91W40 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Klc3Q91W40 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Klc3Q91W40 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Klc3Q91W40 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Klc3Q91W40 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Klc3Q91W40 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Klc3Q91W40 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Klc3Q91W40 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Klc3Q91W40 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Klc3Q91W40 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Klc3Q91W40 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Klc3Q91W40 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Klc3Q91W40 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Klc3Q91W40 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Klc3Q91W40 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Klc3Q91W40 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Klc3Q91W40 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Klc3Q91W40 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Klc3Q91W40 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Klc3Q91W40 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Klc3Q91W40 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Klc3Q91W40 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Klc3Q91W40 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Klc3Q91W40 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Klc3Q91W40 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Klc3Q91W40 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Klc3Q91W40 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Klc3Q91W40 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Klc3Q91W40 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Klc3Q91W40 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Klc3Q91W40 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Klc3Q91W40 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Klc3Q91W40 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Klc3Q91W40 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Klc3Q91W40 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Klc3Q91W40 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Klc3Q91W40 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Klc3Q91W40 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Klc3Q91W40 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Klc3Q91W40 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Klc3Q91W40 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Klc3Q91W40 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Klc3Q91W40 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Klc3Q91W40 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Klc3Q91W40 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Klc3Q91W40 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Klc3Q91W40 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Klc3Q91W40 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Klc3Q91W40 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Klc3Q91W40 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Klc3Q91W40 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Klc3Q91W40 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Klc3Q91W40 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Klc3Q91W40 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Klc3Q91W40 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Klc3Q91W40 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Klc3Q91W40 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Klc3Q91W40 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Klc3Q91W40 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Klc3Q91W40 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Klc3Q91W40 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Klc3Q91W40 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Klc3Q91W40 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Klc3Q91W40 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Klc3Q91W40 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Klc3Q91W40 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Klc3Q91W40 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Klc3Q91W40 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Klc3Q91W40 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Klc3Q91W40 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Klc3Q91W40 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Klc3Q91W40 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Klc3Q91W40 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Klc3Q91W40 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Klc3Q91W40 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Klc3Q91W40 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Klc3Q91W40 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Klc3Q91W40 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Klc3Q91W40 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Klc3Q91W40 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Klc3Q91W40 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Klc3Q91W40 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Klc3Q91W40 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Klc3Q91W40 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Klc3Q91W40 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Klc3Q91W40 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Klc3Q91W40 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Klc3Q91W40 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Klc3Q91W40 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Klc3Q91W40 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Klc3Q91W40 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Klc3Q91W40 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Klc3Q91W40 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Klc3Q91W40 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Klc3Q91W40 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Klc3Q91W40 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Klc3Q91W40 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Klc3Q91W40 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Klc3Q91W40 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Klc3Q91W40 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms