Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHC3

Selenom, Selenoprotein M, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SelenomQ8VHC3 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SelenomQ8VHC3 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SelenomQ8VHC3 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SelenomQ8VHC3 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SelenomQ8VHC3 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SelenomQ8VHC3 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
SelenomQ8VHC3 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SelenomQ8VHC3 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
SelenomQ8VHC3 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SelenomQ8VHC3 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SelenomQ8VHC3 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SelenomQ8VHC3 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SelenomQ8VHC3 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SelenomQ8VHC3 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
SelenomQ8VHC3 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
SelenomQ8VHC3 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC17.39■□□□□ 0.38
SelenomQ8VHC3 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SelenomQ8VHC3 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SelenomQ8VHC3 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SelenomQ8VHC3 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SelenomQ8VHC3 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SelenomQ8VHC3 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
SelenomQ8VHC3 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SelenomQ8VHC3 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SelenomQ8VHC3 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SelenomQ8VHC3 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SelenomQ8VHC3 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SelenomQ8VHC3 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SelenomQ8VHC3 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SelenomQ8VHC3 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SelenomQ8VHC3 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SelenomQ8VHC3 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SelenomQ8VHC3 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SelenomQ8VHC3 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SelenomQ8VHC3 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SelenomQ8VHC3 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SelenomQ8VHC3 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SelenomQ8VHC3 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SelenomQ8VHC3 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SelenomQ8VHC3 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SelenomQ8VHC3 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SelenomQ8VHC3 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SelenomQ8VHC3 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SelenomQ8VHC3 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SelenomQ8VHC3 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SelenomQ8VHC3 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SelenomQ8VHC3 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SelenomQ8VHC3 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SelenomQ8VHC3 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SelenomQ8VHC3 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SelenomQ8VHC3 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SelenomQ8VHC3 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SelenomQ8VHC3 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SelenomQ8VHC3 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SelenomQ8VHC3 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SelenomQ8VHC3 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SelenomQ8VHC3 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SelenomQ8VHC3 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SelenomQ8VHC3 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SelenomQ8VHC3 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SelenomQ8VHC3 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SelenomQ8VHC3 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SelenomQ8VHC3 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SelenomQ8VHC3 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SelenomQ8VHC3 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SelenomQ8VHC3 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SelenomQ8VHC3 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SelenomQ8VHC3 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SelenomQ8VHC3 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SelenomQ8VHC3 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SelenomQ8VHC3 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SelenomQ8VHC3 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SelenomQ8VHC3 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SelenomQ8VHC3 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SelenomQ8VHC3 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SelenomQ8VHC3 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SelenomQ8VHC3 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SelenomQ8VHC3 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SelenomQ8VHC3 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SelenomQ8VHC3 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SelenomQ8VHC3 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SelenomQ8VHC3 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SelenomQ8VHC3 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SelenomQ8VHC3 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SelenomQ8VHC3 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SelenomQ8VHC3 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SelenomQ8VHC3 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SelenomQ8VHC3 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SelenomQ8VHC3 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SelenomQ8VHC3 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SelenomQ8VHC3 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SelenomQ8VHC3 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SelenomQ8VHC3 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SelenomQ8VHC3 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SelenomQ8VHC3 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SelenomQ8VHC3 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SelenomQ8VHC3 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SelenomQ8VHC3 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SelenomQ8VHC3 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SelenomQ8VHC3 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms