Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE99

Ccdc115, Coiled-coil domain-containing protein 115, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc115Q8VE99 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc115Q8VE99 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc115Q8VE99 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc115Q8VE99 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc115Q8VE99 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc115Q8VE99 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc115Q8VE99 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc115Q8VE99 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc115Q8VE99 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc115Q8VE99 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc115Q8VE99 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc115Q8VE99 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc115Q8VE99 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc115Q8VE99 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc115Q8VE99 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc115Q8VE99 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc115Q8VE99 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc115Q8VE99 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc115Q8VE99 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc115Q8VE99 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc115Q8VE99 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc115Q8VE99 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc115Q8VE99 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc115Q8VE99 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc115Q8VE99 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc115Q8VE99 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc115Q8VE99 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc115Q8VE99 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc115Q8VE99 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc115Q8VE99 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc115Q8VE99 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc115Q8VE99 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc115Q8VE99 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Ccdc115Q8VE99 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc115Q8VE99 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc115Q8VE99 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc115Q8VE99 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc115Q8VE99 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc115Q8VE99 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc115Q8VE99 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc115Q8VE99 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc115Q8VE99 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc115Q8VE99 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc115Q8VE99 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc115Q8VE99 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc115Q8VE99 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc115Q8VE99 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc115Q8VE99 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc115Q8VE99 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc115Q8VE99 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc115Q8VE99 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc115Q8VE99 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc115Q8VE99 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc115Q8VE99 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc115Q8VE99 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc115Q8VE99 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc115Q8VE99 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc115Q8VE99 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc115Q8VE99 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc115Q8VE99 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc115Q8VE99 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc115Q8VE99 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc115Q8VE99 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc115Q8VE99 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc115Q8VE99 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc115Q8VE99 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc115Q8VE99 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc115Q8VE99 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc115Q8VE99 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc115Q8VE99 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc115Q8VE99 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc115Q8VE99 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc115Q8VE99 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc115Q8VE99 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc115Q8VE99 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc115Q8VE99 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc115Q8VE99 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc115Q8VE99 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc115Q8VE99 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc115Q8VE99 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc115Q8VE99 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc115Q8VE99 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc115Q8VE99 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc115Q8VE99 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc115Q8VE99 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc115Q8VE99 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc115Q8VE99 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc115Q8VE99 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc115Q8VE99 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc115Q8VE99 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc115Q8VE99 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc115Q8VE99 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc115Q8VE99 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc115Q8VE99 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc115Q8VE99 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc115Q8VE99 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc115Q8VE99 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc115Q8VE99 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc115Q8VE99 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc115Q8VE99 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms