Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH8

Ubxn4, UBX domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 506 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn4Q8VCH8 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ubxn4Q8VCH8 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ubxn4Q8VCH8 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ubxn4Q8VCH8 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ubxn4Q8VCH8 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ubxn4Q8VCH8 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ubxn4Q8VCH8 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ubxn4Q8VCH8 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ubxn4Q8VCH8 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Ubxn4Q8VCH8 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ubxn4Q8VCH8 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ubxn4Q8VCH8 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Ubxn4Q8VCH8 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ubxn4Q8VCH8 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ubxn4Q8VCH8 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ubxn4Q8VCH8 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ubxn4Q8VCH8 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ubxn4Q8VCH8 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ubxn4Q8VCH8 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ubxn4Q8VCH8 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ubxn4Q8VCH8 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ubxn4Q8VCH8 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ubxn4Q8VCH8 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ubxn4Q8VCH8 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ubxn4Q8VCH8 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ubxn4Q8VCH8 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ubxn4Q8VCH8 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ubxn4Q8VCH8 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ubxn4Q8VCH8 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Ubxn4Q8VCH8 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ubxn4Q8VCH8 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ubxn4Q8VCH8 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ubxn4Q8VCH8 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ubxn4Q8VCH8 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ubxn4Q8VCH8 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ubxn4Q8VCH8 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ubxn4Q8VCH8 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Ubxn4Q8VCH8 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ubxn4Q8VCH8 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ubxn4Q8VCH8 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ubxn4Q8VCH8 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ubxn4Q8VCH8 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ubxn4Q8VCH8 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ubxn4Q8VCH8 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ubxn4Q8VCH8 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ubxn4Q8VCH8 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ubxn4Q8VCH8 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Ubxn4Q8VCH8 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ubxn4Q8VCH8 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Ubxn4Q8VCH8 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ubxn4Q8VCH8 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ubxn4Q8VCH8 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Ubxn4Q8VCH8 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ubxn4Q8VCH8 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ubxn4Q8VCH8 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ubxn4Q8VCH8 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ubxn4Q8VCH8 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ubxn4Q8VCH8 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ubxn4Q8VCH8 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ubxn4Q8VCH8 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ubxn4Q8VCH8 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ubxn4Q8VCH8 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ubxn4Q8VCH8 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ubxn4Q8VCH8 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ubxn4Q8VCH8 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ubxn4Q8VCH8 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ubxn4Q8VCH8 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ubxn4Q8VCH8 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Ubxn4Q8VCH8 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ubxn4Q8VCH8 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ubxn4Q8VCH8 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ubxn4Q8VCH8 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ubxn4Q8VCH8 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ubxn4Q8VCH8 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ubxn4Q8VCH8 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ubxn4Q8VCH8 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ubxn4Q8VCH8 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ubxn4Q8VCH8 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Ubxn4Q8VCH8 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ubxn4Q8VCH8 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ubxn4Q8VCH8 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ubxn4Q8VCH8 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ubxn4Q8VCH8 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ubxn4Q8VCH8 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ubxn4Q8VCH8 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ubxn4Q8VCH8 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ubxn4Q8VCH8 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ubxn4Q8VCH8 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ubxn4Q8VCH8 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ubxn4Q8VCH8 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ubxn4Q8VCH8 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ubxn4Q8VCH8 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ubxn4Q8VCH8 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ubxn4Q8VCH8 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ubxn4Q8VCH8 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ubxn4Q8VCH8 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ubxn4Q8VCH8 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ubxn4Q8VCH8 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ubxn4Q8VCH8 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ubxn4Q8VCH8 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
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