Protein–RNA interactions for Protein: Q8R0F3

Sumf1, Sulfatase-modifying factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sumf1Q8R0F3 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sumf1Q8R0F3 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sumf1Q8R0F3 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sumf1Q8R0F3 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sumf1Q8R0F3 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sumf1Q8R0F3 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sumf1Q8R0F3 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Sumf1Q8R0F3 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sumf1Q8R0F3 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sumf1Q8R0F3 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sumf1Q8R0F3 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sumf1Q8R0F3 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sumf1Q8R0F3 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sumf1Q8R0F3 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sumf1Q8R0F3 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sumf1Q8R0F3 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sumf1Q8R0F3 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sumf1Q8R0F3 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Sumf1Q8R0F3 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sumf1Q8R0F3 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sumf1Q8R0F3 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sumf1Q8R0F3 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sumf1Q8R0F3 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sumf1Q8R0F3 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sumf1Q8R0F3 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sumf1Q8R0F3 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sumf1Q8R0F3 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sumf1Q8R0F3 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sumf1Q8R0F3 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sumf1Q8R0F3 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sumf1Q8R0F3 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sumf1Q8R0F3 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sumf1Q8R0F3 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sumf1Q8R0F3 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sumf1Q8R0F3 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sumf1Q8R0F3 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sumf1Q8R0F3 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sumf1Q8R0F3 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sumf1Q8R0F3 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sumf1Q8R0F3 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sumf1Q8R0F3 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Sumf1Q8R0F3 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sumf1Q8R0F3 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sumf1Q8R0F3 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sumf1Q8R0F3 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sumf1Q8R0F3 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sumf1Q8R0F3 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sumf1Q8R0F3 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sumf1Q8R0F3 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sumf1Q8R0F3 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sumf1Q8R0F3 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sumf1Q8R0F3 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sumf1Q8R0F3 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sumf1Q8R0F3 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sumf1Q8R0F3 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sumf1Q8R0F3 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sumf1Q8R0F3 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sumf1Q8R0F3 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sumf1Q8R0F3 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sumf1Q8R0F3 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sumf1Q8R0F3 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sumf1Q8R0F3 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Sumf1Q8R0F3 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sumf1Q8R0F3 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sumf1Q8R0F3 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sumf1Q8R0F3 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sumf1Q8R0F3 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sumf1Q8R0F3 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sumf1Q8R0F3 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sumf1Q8R0F3 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sumf1Q8R0F3 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sumf1Q8R0F3 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sumf1Q8R0F3 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sumf1Q8R0F3 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sumf1Q8R0F3 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sumf1Q8R0F3 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sumf1Q8R0F3 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sumf1Q8R0F3 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sumf1Q8R0F3 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sumf1Q8R0F3 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sumf1Q8R0F3 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sumf1Q8R0F3 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Sumf1Q8R0F3 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sumf1Q8R0F3 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sumf1Q8R0F3 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sumf1Q8R0F3 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sumf1Q8R0F3 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sumf1Q8R0F3 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sumf1Q8R0F3 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sumf1Q8R0F3 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sumf1Q8R0F3 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sumf1Q8R0F3 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sumf1Q8R0F3 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sumf1Q8R0F3 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sumf1Q8R0F3 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Sumf1Q8R0F3 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sumf1Q8R0F3 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sumf1Q8R0F3 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sumf1Q8R0F3 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sumf1Q8R0F3 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms