Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4P8

Hecw1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, mousemouse

Predictions only

Length 1,604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hecw1Q8K4P8 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Hecw1Q8K4P8 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Hecw1Q8K4P8 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Hecw1Q8K4P8 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Hecw1Q8K4P8 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Hecw1Q8K4P8 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Hecw1Q8K4P8 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Hecw1Q8K4P8 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Hecw1Q8K4P8 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Hecw1Q8K4P8 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Hecw1Q8K4P8 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Hecw1Q8K4P8 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Hecw1Q8K4P8 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Hecw1Q8K4P8 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Hecw1Q8K4P8 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Hecw1Q8K4P8 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Hecw1Q8K4P8 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Hecw1Q8K4P8 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Hecw1Q8K4P8 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Hecw1Q8K4P8 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Hecw1Q8K4P8 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Hecw1Q8K4P8 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Hecw1Q8K4P8 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Hecw1Q8K4P8 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Hecw1Q8K4P8 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Hecw1Q8K4P8 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Hecw1Q8K4P8 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Hecw1Q8K4P8 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Hecw1Q8K4P8 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Hecw1Q8K4P8 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Hecw1Q8K4P8 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Hecw1Q8K4P8 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Hecw1Q8K4P8 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Hecw1Q8K4P8 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Hecw1Q8K4P8 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Hecw1Q8K4P8 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Hecw1Q8K4P8 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Hecw1Q8K4P8 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Hecw1Q8K4P8 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Hecw1Q8K4P8 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Hecw1Q8K4P8 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Hecw1Q8K4P8 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Hecw1Q8K4P8 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Hecw1Q8K4P8 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Hecw1Q8K4P8 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Hecw1Q8K4P8 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Hecw1Q8K4P8 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Hecw1Q8K4P8 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Hecw1Q8K4P8 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Hecw1Q8K4P8 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Hecw1Q8K4P8 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Hecw1Q8K4P8 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Hecw1Q8K4P8 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Hecw1Q8K4P8 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Hecw1Q8K4P8 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Hecw1Q8K4P8 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
Hecw1Q8K4P8 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
Hecw1Q8K4P8 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Hecw1Q8K4P8 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Hecw1Q8K4P8 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Hecw1Q8K4P8 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Hecw1Q8K4P8 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Hecw1Q8K4P8 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Hecw1Q8K4P8 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Hecw1Q8K4P8 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Hecw1Q8K4P8 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Hecw1Q8K4P8 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Hecw1Q8K4P8 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Hecw1Q8K4P8 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Hecw1Q8K4P8 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Hecw1Q8K4P8 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Hecw1Q8K4P8 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Hecw1Q8K4P8 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Hecw1Q8K4P8 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Hecw1Q8K4P8 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Hecw1Q8K4P8 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Hecw1Q8K4P8 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Hecw1Q8K4P8 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Hecw1Q8K4P8 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Hecw1Q8K4P8 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Hecw1Q8K4P8 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Hecw1Q8K4P8 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Hecw1Q8K4P8 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Hecw1Q8K4P8 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Hecw1Q8K4P8 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Hecw1Q8K4P8 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Hecw1Q8K4P8 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Hecw1Q8K4P8 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Hecw1Q8K4P8 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Hecw1Q8K4P8 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Hecw1Q8K4P8 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Hecw1Q8K4P8 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Hecw1Q8K4P8 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Hecw1Q8K4P8 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Hecw1Q8K4P8 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Hecw1Q8K4P8 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Hecw1Q8K4P8 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Hecw1Q8K4P8 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Hecw1Q8K4P8 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Hecw1Q8K4P8 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms