Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Z4

Ncapd2, Condensin complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncapd2Q8K2Z4 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ncapd2Q8K2Z4 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Ncapd2Q8K2Z4 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ncapd2Q8K2Z4 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Ncapd2Q8K2Z4 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Ncapd2Q8K2Z4 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Ncapd2Q8K2Z4 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Ncapd2Q8K2Z4 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ncapd2Q8K2Z4 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ncapd2Q8K2Z4 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ncapd2Q8K2Z4 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ncapd2Q8K2Z4 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ncapd2Q8K2Z4 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ncapd2Q8K2Z4 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ncapd2Q8K2Z4 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Ncapd2Q8K2Z4 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ncapd2Q8K2Z4 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ncapd2Q8K2Z4 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ncapd2Q8K2Z4 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ncapd2Q8K2Z4 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ncapd2Q8K2Z4 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ncapd2Q8K2Z4 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ncapd2Q8K2Z4 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Ncapd2Q8K2Z4 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ncapd2Q8K2Z4 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ncapd2Q8K2Z4 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ncapd2Q8K2Z4 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ncapd2Q8K2Z4 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ncapd2Q8K2Z4 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ncapd2Q8K2Z4 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ncapd2Q8K2Z4 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ncapd2Q8K2Z4 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Ncapd2Q8K2Z4 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ncapd2Q8K2Z4 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ncapd2Q8K2Z4 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ncapd2Q8K2Z4 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ncapd2Q8K2Z4 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ncapd2Q8K2Z4 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ncapd2Q8K2Z4 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ncapd2Q8K2Z4 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ncapd2Q8K2Z4 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ncapd2Q8K2Z4 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Ncapd2Q8K2Z4 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Ncapd2Q8K2Z4 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ncapd2Q8K2Z4 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ncapd2Q8K2Z4 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ncapd2Q8K2Z4 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ncapd2Q8K2Z4 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Ncapd2Q8K2Z4 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Ncapd2Q8K2Z4 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ncapd2Q8K2Z4 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Ncapd2Q8K2Z4 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ncapd2Q8K2Z4 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ncapd2Q8K2Z4 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ncapd2Q8K2Z4 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ncapd2Q8K2Z4 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ncapd2Q8K2Z4 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ncapd2Q8K2Z4 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ncapd2Q8K2Z4 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Ncapd2Q8K2Z4 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Ncapd2Q8K2Z4 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Ncapd2Q8K2Z4 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ncapd2Q8K2Z4 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ncapd2Q8K2Z4 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ncapd2Q8K2Z4 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ncapd2Q8K2Z4 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ncapd2Q8K2Z4 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Ncapd2Q8K2Z4 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ncapd2Q8K2Z4 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ncapd2Q8K2Z4 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ncapd2Q8K2Z4 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ncapd2Q8K2Z4 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ncapd2Q8K2Z4 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ncapd2Q8K2Z4 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ncapd2Q8K2Z4 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Ncapd2Q8K2Z4 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Ncapd2Q8K2Z4 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Ncapd2Q8K2Z4 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Ncapd2Q8K2Z4 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ncapd2Q8K2Z4 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ncapd2Q8K2Z4 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ncapd2Q8K2Z4 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ncapd2Q8K2Z4 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ncapd2Q8K2Z4 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ncapd2Q8K2Z4 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ncapd2Q8K2Z4 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ncapd2Q8K2Z4 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ncapd2Q8K2Z4 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ncapd2Q8K2Z4 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ncapd2Q8K2Z4 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ncapd2Q8K2Z4 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ncapd2Q8K2Z4 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ncapd2Q8K2Z4 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ncapd2Q8K2Z4 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Ncapd2Q8K2Z4 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ncapd2Q8K2Z4 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ncapd2Q8K2Z4 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ncapd2Q8K2Z4 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ncapd2Q8K2Z4 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ncapd2Q8K2Z4 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.7 ms