Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2L8

Trappc12, Trafficking protein particle complex subunit 12, mousemouse

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc12Q8K2L8 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trappc12Q8K2L8 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trappc12Q8K2L8 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trappc12Q8K2L8 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trappc12Q8K2L8 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trappc12Q8K2L8 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trappc12Q8K2L8 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trappc12Q8K2L8 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trappc12Q8K2L8 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trappc12Q8K2L8 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trappc12Q8K2L8 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trappc12Q8K2L8 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trappc12Q8K2L8 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trappc12Q8K2L8 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trappc12Q8K2L8 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trappc12Q8K2L8 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Trappc12Q8K2L8 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Trappc12Q8K2L8 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trappc12Q8K2L8 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trappc12Q8K2L8 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trappc12Q8K2L8 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trappc12Q8K2L8 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trappc12Q8K2L8 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trappc12Q8K2L8 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trappc12Q8K2L8 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trappc12Q8K2L8 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trappc12Q8K2L8 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trappc12Q8K2L8 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Trappc12Q8K2L8 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trappc12Q8K2L8 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trappc12Q8K2L8 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trappc12Q8K2L8 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trappc12Q8K2L8 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trappc12Q8K2L8 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trappc12Q8K2L8 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trappc12Q8K2L8 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trappc12Q8K2L8 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trappc12Q8K2L8 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trappc12Q8K2L8 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trappc12Q8K2L8 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trappc12Q8K2L8 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trappc12Q8K2L8 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trappc12Q8K2L8 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trappc12Q8K2L8 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trappc12Q8K2L8 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Trappc12Q8K2L8 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trappc12Q8K2L8 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trappc12Q8K2L8 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trappc12Q8K2L8 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trappc12Q8K2L8 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trappc12Q8K2L8 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Trappc12Q8K2L8 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trappc12Q8K2L8 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Trappc12Q8K2L8 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Trappc12Q8K2L8 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trappc12Q8K2L8 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trappc12Q8K2L8 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trappc12Q8K2L8 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trappc12Q8K2L8 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trappc12Q8K2L8 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trappc12Q8K2L8 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trappc12Q8K2L8 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trappc12Q8K2L8 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trappc12Q8K2L8 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trappc12Q8K2L8 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trappc12Q8K2L8 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Trappc12Q8K2L8 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trappc12Q8K2L8 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trappc12Q8K2L8 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trappc12Q8K2L8 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trappc12Q8K2L8 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trappc12Q8K2L8 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trappc12Q8K2L8 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trappc12Q8K2L8 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trappc12Q8K2L8 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trappc12Q8K2L8 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trappc12Q8K2L8 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trappc12Q8K2L8 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trappc12Q8K2L8 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trappc12Q8K2L8 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trappc12Q8K2L8 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trappc12Q8K2L8 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trappc12Q8K2L8 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trappc12Q8K2L8 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trappc12Q8K2L8 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trappc12Q8K2L8 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trappc12Q8K2L8 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trappc12Q8K2L8 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trappc12Q8K2L8 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trappc12Q8K2L8 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Trappc12Q8K2L8 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trappc12Q8K2L8 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trappc12Q8K2L8 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trappc12Q8K2L8 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trappc12Q8K2L8 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trappc12Q8K2L8 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trappc12Q8K2L8 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trappc12Q8K2L8 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trappc12Q8K2L8 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trappc12Q8K2L8 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms