Protein–RNA interactions for Protein: Q8C3X2

Ccdc90b, Coiled-coil domain-containing protein 90B, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc90bQ8C3X2 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc90bQ8C3X2 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc90bQ8C3X2 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc90bQ8C3X2 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc90bQ8C3X2 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc90bQ8C3X2 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc90bQ8C3X2 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc90bQ8C3X2 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc90bQ8C3X2 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc90bQ8C3X2 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc90bQ8C3X2 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc90bQ8C3X2 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc90bQ8C3X2 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc90bQ8C3X2 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc90bQ8C3X2 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc90bQ8C3X2 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc90bQ8C3X2 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc90bQ8C3X2 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc90bQ8C3X2 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc90bQ8C3X2 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc90bQ8C3X2 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc90bQ8C3X2 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc90bQ8C3X2 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc90bQ8C3X2 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc90bQ8C3X2 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc90bQ8C3X2 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc90bQ8C3X2 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc90bQ8C3X2 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc90bQ8C3X2 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc90bQ8C3X2 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc90bQ8C3X2 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc90bQ8C3X2 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc90bQ8C3X2 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc90bQ8C3X2 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc90bQ8C3X2 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc90bQ8C3X2 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc90bQ8C3X2 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc90bQ8C3X2 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc90bQ8C3X2 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc90bQ8C3X2 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc90bQ8C3X2 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc90bQ8C3X2 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc90bQ8C3X2 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc90bQ8C3X2 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc90bQ8C3X2 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc90bQ8C3X2 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc90bQ8C3X2 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc90bQ8C3X2 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc90bQ8C3X2 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc90bQ8C3X2 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc90bQ8C3X2 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc90bQ8C3X2 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc90bQ8C3X2 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc90bQ8C3X2 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc90bQ8C3X2 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc90bQ8C3X2 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc90bQ8C3X2 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc90bQ8C3X2 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc90bQ8C3X2 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc90bQ8C3X2 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc90bQ8C3X2 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc90bQ8C3X2 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc90bQ8C3X2 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc90bQ8C3X2 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc90bQ8C3X2 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc90bQ8C3X2 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc90bQ8C3X2 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc90bQ8C3X2 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccdc90bQ8C3X2 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccdc90bQ8C3X2 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccdc90bQ8C3X2 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccdc90bQ8C3X2 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccdc90bQ8C3X2 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc90bQ8C3X2 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc90bQ8C3X2 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc90bQ8C3X2 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc90bQ8C3X2 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc90bQ8C3X2 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc90bQ8C3X2 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc90bQ8C3X2 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc90bQ8C3X2 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc90bQ8C3X2 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc90bQ8C3X2 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc90bQ8C3X2 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc90bQ8C3X2 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc90bQ8C3X2 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc90bQ8C3X2 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc90bQ8C3X2 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc90bQ8C3X2 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc90bQ8C3X2 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc90bQ8C3X2 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc90bQ8C3X2 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc90bQ8C3X2 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc90bQ8C3X2 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc90bQ8C3X2 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc90bQ8C3X2 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc90bQ8C3X2 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc90bQ8C3X2 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc90bQ8C3X2 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc90bQ8C3X2 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms