Protein–RNA interactions for Protein: Q8BYH8

Chd9, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 2,885 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd9Q8BYH8 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Chd9Q8BYH8 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Chd9Q8BYH8 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Chd9Q8BYH8 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Chd9Q8BYH8 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Chd9Q8BYH8 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Chd9Q8BYH8 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Chd9Q8BYH8 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Chd9Q8BYH8 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Chd9Q8BYH8 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Chd9Q8BYH8 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Chd9Q8BYH8 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Chd9Q8BYH8 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Chd9Q8BYH8 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Chd9Q8BYH8 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Chd9Q8BYH8 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Chd9Q8BYH8 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Chd9Q8BYH8 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Chd9Q8BYH8 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Chd9Q8BYH8 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Chd9Q8BYH8 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Chd9Q8BYH8 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Chd9Q8BYH8 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Chd9Q8BYH8 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Chd9Q8BYH8 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Chd9Q8BYH8 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Chd9Q8BYH8 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chd9Q8BYH8 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chd9Q8BYH8 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chd9Q8BYH8 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chd9Q8BYH8 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chd9Q8BYH8 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chd9Q8BYH8 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chd9Q8BYH8 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chd9Q8BYH8 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chd9Q8BYH8 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chd9Q8BYH8 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chd9Q8BYH8 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chd9Q8BYH8 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chd9Q8BYH8 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chd9Q8BYH8 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chd9Q8BYH8 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Chd9Q8BYH8 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Chd9Q8BYH8 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Chd9Q8BYH8 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Chd9Q8BYH8 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Chd9Q8BYH8 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Chd9Q8BYH8 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Chd9Q8BYH8 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Chd9Q8BYH8 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Chd9Q8BYH8 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Chd9Q8BYH8 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Chd9Q8BYH8 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Chd9Q8BYH8 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Chd9Q8BYH8 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Chd9Q8BYH8 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Chd9Q8BYH8 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Chd9Q8BYH8 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Chd9Q8BYH8 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Chd9Q8BYH8 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Chd9Q8BYH8 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Chd9Q8BYH8 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Chd9Q8BYH8 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Chd9Q8BYH8 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
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Chd9Q8BYH8 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Chd9Q8BYH8 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Chd9Q8BYH8 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Chd9Q8BYH8 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Chd9Q8BYH8 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
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Chd9Q8BYH8 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Chd9Q8BYH8 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Chd9Q8BYH8 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Chd9Q8BYH8 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Chd9Q8BYH8 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Chd9Q8BYH8 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Chd9Q8BYH8 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Chd9Q8BYH8 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Chd9Q8BYH8 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Chd9Q8BYH8 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Chd9Q8BYH8 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chd9Q8BYH8 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chd9Q8BYH8 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chd9Q8BYH8 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chd9Q8BYH8 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chd9Q8BYH8 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chd9Q8BYH8 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chd9Q8BYH8 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Chd9Q8BYH8 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chd9Q8BYH8 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chd9Q8BYH8 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chd9Q8BYH8 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chd9Q8BYH8 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chd9Q8BYH8 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chd9Q8BYH8 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chd9Q8BYH8 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Chd9Q8BYH8 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms