Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX46

Skor1, SKI family transcriptional corepressor 1, mousemouse

Predictions only

Length 964 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skor1Q8BX46 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Skor1Q8BX46 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Skor1Q8BX46 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Skor1Q8BX46 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Skor1Q8BX46 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Skor1Q8BX46 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Skor1Q8BX46 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Skor1Q8BX46 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Skor1Q8BX46 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Skor1Q8BX46 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Skor1Q8BX46 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Skor1Q8BX46 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Skor1Q8BX46 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Skor1Q8BX46 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Skor1Q8BX46 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Skor1Q8BX46 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Skor1Q8BX46 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Skor1Q8BX46 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Skor1Q8BX46 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Skor1Q8BX46 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Skor1Q8BX46 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Skor1Q8BX46 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Skor1Q8BX46 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Skor1Q8BX46 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Skor1Q8BX46 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Skor1Q8BX46 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Skor1Q8BX46 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Skor1Q8BX46 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Skor1Q8BX46 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Skor1Q8BX46 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Skor1Q8BX46 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Skor1Q8BX46 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Skor1Q8BX46 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Skor1Q8BX46 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Skor1Q8BX46 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Skor1Q8BX46 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Skor1Q8BX46 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Skor1Q8BX46 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Skor1Q8BX46 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Skor1Q8BX46 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Skor1Q8BX46 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Skor1Q8BX46 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Skor1Q8BX46 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Skor1Q8BX46 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Skor1Q8BX46 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Skor1Q8BX46 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Skor1Q8BX46 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Skor1Q8BX46 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Skor1Q8BX46 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Skor1Q8BX46 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Skor1Q8BX46 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Skor1Q8BX46 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Skor1Q8BX46 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Skor1Q8BX46 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Skor1Q8BX46 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Skor1Q8BX46 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Skor1Q8BX46 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Skor1Q8BX46 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Skor1Q8BX46 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Skor1Q8BX46 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Skor1Q8BX46 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Skor1Q8BX46 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Skor1Q8BX46 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Skor1Q8BX46 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Skor1Q8BX46 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Skor1Q8BX46 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Skor1Q8BX46 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Skor1Q8BX46 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Skor1Q8BX46 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Skor1Q8BX46 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Skor1Q8BX46 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Skor1Q8BX46 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Skor1Q8BX46 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Skor1Q8BX46 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Skor1Q8BX46 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Skor1Q8BX46 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Skor1Q8BX46 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Skor1Q8BX46 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Skor1Q8BX46 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Skor1Q8BX46 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Skor1Q8BX46 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Skor1Q8BX46 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Skor1Q8BX46 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Skor1Q8BX46 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Skor1Q8BX46 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Skor1Q8BX46 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Skor1Q8BX46 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Skor1Q8BX46 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Skor1Q8BX46 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Skor1Q8BX46 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Skor1Q8BX46 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Skor1Q8BX46 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Skor1Q8BX46 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Skor1Q8BX46 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Skor1Q8BX46 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Skor1Q8BX46 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Skor1Q8BX46 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Skor1Q8BX46 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Skor1Q8BX46 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Skor1Q8BX46 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms