Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKI2

Tnrc6b, Trinucleotide repeat-containing gene 6B protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,810 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnrc6bQ8BKI2 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tnrc6bQ8BKI2 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tnrc6bQ8BKI2 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tnrc6bQ8BKI2 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tnrc6bQ8BKI2 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Tnrc6bQ8BKI2 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tnrc6bQ8BKI2 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tnrc6bQ8BKI2 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tnrc6bQ8BKI2 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tnrc6bQ8BKI2 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Tnrc6bQ8BKI2 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Tnrc6bQ8BKI2 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Tnrc6bQ8BKI2 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tnrc6bQ8BKI2 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tnrc6bQ8BKI2 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tnrc6bQ8BKI2 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tnrc6bQ8BKI2 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tnrc6bQ8BKI2 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tnrc6bQ8BKI2 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tnrc6bQ8BKI2 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tnrc6bQ8BKI2 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tnrc6bQ8BKI2 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tnrc6bQ8BKI2 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tnrc6bQ8BKI2 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tnrc6bQ8BKI2 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Tnrc6bQ8BKI2 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tnrc6bQ8BKI2 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tnrc6bQ8BKI2 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Tnrc6bQ8BKI2 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tnrc6bQ8BKI2 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tnrc6bQ8BKI2 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tnrc6bQ8BKI2 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tnrc6bQ8BKI2 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tnrc6bQ8BKI2 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tnrc6bQ8BKI2 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tnrc6bQ8BKI2 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Tnrc6bQ8BKI2 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Tnrc6bQ8BKI2 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
Tnrc6bQ8BKI2 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Tnrc6bQ8BKI2 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Tnrc6bQ8BKI2 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Tnrc6bQ8BKI2 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Tnrc6bQ8BKI2 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Tnrc6bQ8BKI2 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Tnrc6bQ8BKI2 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Tnrc6bQ8BKI2 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Tnrc6bQ8BKI2 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Tnrc6bQ8BKI2 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tnrc6bQ8BKI2 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tnrc6bQ8BKI2 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tnrc6bQ8BKI2 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Tnrc6bQ8BKI2 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Tnrc6bQ8BKI2 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tnrc6bQ8BKI2 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tnrc6bQ8BKI2 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tnrc6bQ8BKI2 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tnrc6bQ8BKI2 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tnrc6bQ8BKI2 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tnrc6bQ8BKI2 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tnrc6bQ8BKI2 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tnrc6bQ8BKI2 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tnrc6bQ8BKI2 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tnrc6bQ8BKI2 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tnrc6bQ8BKI2 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tnrc6bQ8BKI2 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tnrc6bQ8BKI2 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tnrc6bQ8BKI2 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tnrc6bQ8BKI2 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tnrc6bQ8BKI2 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tnrc6bQ8BKI2 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tnrc6bQ8BKI2 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tnrc6bQ8BKI2 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tnrc6bQ8BKI2 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tnrc6bQ8BKI2 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tnrc6bQ8BKI2 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Tnrc6bQ8BKI2 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tnrc6bQ8BKI2 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tnrc6bQ8BKI2 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tnrc6bQ8BKI2 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tnrc6bQ8BKI2 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tnrc6bQ8BKI2 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tnrc6bQ8BKI2 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tnrc6bQ8BKI2 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tnrc6bQ8BKI2 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tnrc6bQ8BKI2 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tnrc6bQ8BKI2 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tnrc6bQ8BKI2 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tnrc6bQ8BKI2 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tnrc6bQ8BKI2 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tnrc6bQ8BKI2 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tnrc6bQ8BKI2 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tnrc6bQ8BKI2 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tnrc6bQ8BKI2 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tnrc6bQ8BKI2 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Tnrc6bQ8BKI2 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Tnrc6bQ8BKI2 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Tnrc6bQ8BKI2 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Tnrc6bQ8BKI2 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Tnrc6bQ8BKI2 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Tnrc6bQ8BKI2 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms