Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGA3

Lrrtm2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm2Q8BGA3 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lrrtm2Q8BGA3 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lrrtm2Q8BGA3 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lrrtm2Q8BGA3 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lrrtm2Q8BGA3 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lrrtm2Q8BGA3 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lrrtm2Q8BGA3 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lrrtm2Q8BGA3 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lrrtm2Q8BGA3 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lrrtm2Q8BGA3 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lrrtm2Q8BGA3 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lrrtm2Q8BGA3 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lrrtm2Q8BGA3 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lrrtm2Q8BGA3 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lrrtm2Q8BGA3 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lrrtm2Q8BGA3 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lrrtm2Q8BGA3 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lrrtm2Q8BGA3 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lrrtm2Q8BGA3 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lrrtm2Q8BGA3 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lrrtm2Q8BGA3 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lrrtm2Q8BGA3 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lrrtm2Q8BGA3 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lrrtm2Q8BGA3 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lrrtm2Q8BGA3 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lrrtm2Q8BGA3 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lrrtm2Q8BGA3 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lrrtm2Q8BGA3 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lrrtm2Q8BGA3 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lrrtm2Q8BGA3 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lrrtm2Q8BGA3 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lrrtm2Q8BGA3 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lrrtm2Q8BGA3 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lrrtm2Q8BGA3 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lrrtm2Q8BGA3 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lrrtm2Q8BGA3 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lrrtm2Q8BGA3 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lrrtm2Q8BGA3 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lrrtm2Q8BGA3 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lrrtm2Q8BGA3 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lrrtm2Q8BGA3 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Lrrtm2Q8BGA3 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lrrtm2Q8BGA3 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lrrtm2Q8BGA3 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lrrtm2Q8BGA3 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lrrtm2Q8BGA3 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lrrtm2Q8BGA3 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lrrtm2Q8BGA3 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lrrtm2Q8BGA3 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lrrtm2Q8BGA3 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lrrtm2Q8BGA3 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lrrtm2Q8BGA3 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lrrtm2Q8BGA3 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lrrtm2Q8BGA3 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lrrtm2Q8BGA3 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lrrtm2Q8BGA3 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lrrtm2Q8BGA3 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lrrtm2Q8BGA3 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lrrtm2Q8BGA3 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lrrtm2Q8BGA3 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lrrtm2Q8BGA3 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lrrtm2Q8BGA3 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lrrtm2Q8BGA3 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lrrtm2Q8BGA3 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Lrrtm2Q8BGA3 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lrrtm2Q8BGA3 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lrrtm2Q8BGA3 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lrrtm2Q8BGA3 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lrrtm2Q8BGA3 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lrrtm2Q8BGA3 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lrrtm2Q8BGA3 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lrrtm2Q8BGA3 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lrrtm2Q8BGA3 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Lrrtm2Q8BGA3 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lrrtm2Q8BGA3 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Lrrtm2Q8BGA3 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Lrrtm2Q8BGA3 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lrrtm2Q8BGA3 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lrrtm2Q8BGA3 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lrrtm2Q8BGA3 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lrrtm2Q8BGA3 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lrrtm2Q8BGA3 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lrrtm2Q8BGA3 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lrrtm2Q8BGA3 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lrrtm2Q8BGA3 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lrrtm2Q8BGA3 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lrrtm2Q8BGA3 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lrrtm2Q8BGA3 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lrrtm2Q8BGA3 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lrrtm2Q8BGA3 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lrrtm2Q8BGA3 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lrrtm2Q8BGA3 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lrrtm2Q8BGA3 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lrrtm2Q8BGA3 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lrrtm2Q8BGA3 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lrrtm2Q8BGA3 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lrrtm2Q8BGA3 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lrrtm2Q8BGA3 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Lrrtm2Q8BGA3 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lrrtm2Q8BGA3 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.2 ms