Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG71

Trmt12, tRNA wybutosine-synthesizing protein 2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trmt12Q8BG71 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trmt12Q8BG71 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trmt12Q8BG71 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trmt12Q8BG71 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trmt12Q8BG71 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trmt12Q8BG71 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trmt12Q8BG71 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trmt12Q8BG71 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trmt12Q8BG71 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trmt12Q8BG71 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trmt12Q8BG71 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trmt12Q8BG71 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trmt12Q8BG71 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trmt12Q8BG71 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trmt12Q8BG71 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trmt12Q8BG71 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trmt12Q8BG71 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Trmt12Q8BG71 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trmt12Q8BG71 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trmt12Q8BG71 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trmt12Q8BG71 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Trmt12Q8BG71 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trmt12Q8BG71 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trmt12Q8BG71 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trmt12Q8BG71 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trmt12Q8BG71 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trmt12Q8BG71 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trmt12Q8BG71 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trmt12Q8BG71 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trmt12Q8BG71 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trmt12Q8BG71 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trmt12Q8BG71 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trmt12Q8BG71 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trmt12Q8BG71 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trmt12Q8BG71 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trmt12Q8BG71 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trmt12Q8BG71 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trmt12Q8BG71 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trmt12Q8BG71 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trmt12Q8BG71 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trmt12Q8BG71 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trmt12Q8BG71 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Trmt12Q8BG71 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trmt12Q8BG71 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trmt12Q8BG71 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trmt12Q8BG71 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trmt12Q8BG71 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trmt12Q8BG71 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trmt12Q8BG71 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Trmt12Q8BG71 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trmt12Q8BG71 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trmt12Q8BG71 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trmt12Q8BG71 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Trmt12Q8BG71 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Trmt12Q8BG71 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trmt12Q8BG71 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trmt12Q8BG71 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trmt12Q8BG71 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trmt12Q8BG71 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trmt12Q8BG71 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trmt12Q8BG71 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trmt12Q8BG71 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Trmt12Q8BG71 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trmt12Q8BG71 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trmt12Q8BG71 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trmt12Q8BG71 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trmt12Q8BG71 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trmt12Q8BG71 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Trmt12Q8BG71 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trmt12Q8BG71 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trmt12Q8BG71 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trmt12Q8BG71 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trmt12Q8BG71 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trmt12Q8BG71 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trmt12Q8BG71 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trmt12Q8BG71 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trmt12Q8BG71 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trmt12Q8BG71 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trmt12Q8BG71 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trmt12Q8BG71 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trmt12Q8BG71 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trmt12Q8BG71 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trmt12Q8BG71 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trmt12Q8BG71 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trmt12Q8BG71 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trmt12Q8BG71 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trmt12Q8BG71 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Trmt12Q8BG71 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trmt12Q8BG71 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trmt12Q8BG71 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trmt12Q8BG71 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trmt12Q8BG71 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trmt12Q8BG71 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trmt12Q8BG71 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trmt12Q8BG71 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trmt12Q8BG71 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trmt12Q8BG71 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trmt12Q8BG71 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trmt12Q8BG71 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Trmt12Q8BG71 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms