Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW9

H2-M10.2, Histocompatibility 2, M region locus 10.2, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.2Q85ZW9 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
H2-M10.2Q85ZW9 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
H2-M10.2Q85ZW9 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
H2-M10.2Q85ZW9 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
H2-M10.2Q85ZW9 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
H2-M10.2Q85ZW9 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
H2-M10.2Q85ZW9 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
H2-M10.2Q85ZW9 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
H2-M10.2Q85ZW9 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
H2-M10.2Q85ZW9 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
H2-M10.2Q85ZW9 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
H2-M10.2Q85ZW9 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
H2-M10.2Q85ZW9 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
H2-M10.2Q85ZW9 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
H2-M10.2Q85ZW9 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
H2-M10.2Q85ZW9 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
H2-M10.2Q85ZW9 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
H2-M10.2Q85ZW9 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
H2-M10.2Q85ZW9 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
H2-M10.2Q85ZW9 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
H2-M10.2Q85ZW9 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
H2-M10.2Q85ZW9 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
H2-M10.2Q85ZW9 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
H2-M10.2Q85ZW9 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
H2-M10.2Q85ZW9 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
H2-M10.2Q85ZW9 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
H2-M10.2Q85ZW9 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
H2-M10.2Q85ZW9 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
H2-M10.2Q85ZW9 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
H2-M10.2Q85ZW9 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
H2-M10.2Q85ZW9 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
H2-M10.2Q85ZW9 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
H2-M10.2Q85ZW9 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
H2-M10.2Q85ZW9 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
H2-M10.2Q85ZW9 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
H2-M10.2Q85ZW9 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
H2-M10.2Q85ZW9 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
H2-M10.2Q85ZW9 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
H2-M10.2Q85ZW9 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
H2-M10.2Q85ZW9 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
H2-M10.2Q85ZW9 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
H2-M10.2Q85ZW9 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
H2-M10.2Q85ZW9 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
H2-M10.2Q85ZW9 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
H2-M10.2Q85ZW9 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
H2-M10.2Q85ZW9 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
H2-M10.2Q85ZW9 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
H2-M10.2Q85ZW9 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
H2-M10.2Q85ZW9 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
H2-M10.2Q85ZW9 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
H2-M10.2Q85ZW9 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
H2-M10.2Q85ZW9 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
H2-M10.2Q85ZW9 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
H2-M10.2Q85ZW9 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
H2-M10.2Q85ZW9 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
H2-M10.2Q85ZW9 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
H2-M10.2Q85ZW9 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
H2-M10.2Q85ZW9 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
H2-M10.2Q85ZW9 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
H2-M10.2Q85ZW9 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
H2-M10.2Q85ZW9 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
H2-M10.2Q85ZW9 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
H2-M10.2Q85ZW9 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
H2-M10.2Q85ZW9 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
H2-M10.2Q85ZW9 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
H2-M10.2Q85ZW9 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
H2-M10.2Q85ZW9 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
H2-M10.2Q85ZW9 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
H2-M10.2Q85ZW9 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
H2-M10.2Q85ZW9 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
H2-M10.2Q85ZW9 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
H2-M10.2Q85ZW9 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
H2-M10.2Q85ZW9 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
H2-M10.2Q85ZW9 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
H2-M10.2Q85ZW9 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
H2-M10.2Q85ZW9 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
H2-M10.2Q85ZW9 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
H2-M10.2Q85ZW9 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
H2-M10.2Q85ZW9 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
H2-M10.2Q85ZW9 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
H2-M10.2Q85ZW9 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
H2-M10.2Q85ZW9 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
H2-M10.2Q85ZW9 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
H2-M10.2Q85ZW9 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
H2-M10.2Q85ZW9 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
H2-M10.2Q85ZW9 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
H2-M10.2Q85ZW9 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
H2-M10.2Q85ZW9 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
H2-M10.2Q85ZW9 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
H2-M10.2Q85ZW9 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
H2-M10.2Q85ZW9 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
H2-M10.2Q85ZW9 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
H2-M10.2Q85ZW9 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
H2-M10.2Q85ZW9 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
H2-M10.2Q85ZW9 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
H2-M10.2Q85ZW9 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
H2-M10.2Q85ZW9 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
H2-M10.2Q85ZW9 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
H2-M10.2Q85ZW9 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
H2-M10.2Q85ZW9 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms