Protein–RNA interactions for Protein: Q80WT0

Jph4, Junctophilin-4, mousemouse

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Jph4Q80WT0 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Jph4Q80WT0 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.12
Jph4Q80WT0 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Jph4Q80WT0 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Jph4Q80WT0 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Jph4Q80WT0 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Jph4Q80WT0 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Jph4Q80WT0 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Jph4Q80WT0 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Jph4Q80WT0 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Jph4Q80WT0 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Jph4Q80WT0 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Jph4Q80WT0 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Jph4Q80WT0 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Jph4Q80WT0 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Jph4Q80WT0 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Jph4Q80WT0 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Jph4Q80WT0 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Jph4Q80WT0 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Jph4Q80WT0 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Jph4Q80WT0 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Jph4Q80WT0 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Jph4Q80WT0 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Jph4Q80WT0 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Jph4Q80WT0 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
Jph4Q80WT0 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Jph4Q80WT0 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Jph4Q80WT0 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Jph4Q80WT0 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Jph4Q80WT0 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Jph4Q80WT0 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Jph4Q80WT0 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Jph4Q80WT0 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Jph4Q80WT0 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Jph4Q80WT0 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Jph4Q80WT0 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Jph4Q80WT0 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Jph4Q80WT0 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Jph4Q80WT0 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Jph4Q80WT0 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Jph4Q80WT0 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
Jph4Q80WT0 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Jph4Q80WT0 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Jph4Q80WT0 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Jph4Q80WT0 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Jph4Q80WT0 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Jph4Q80WT0 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Jph4Q80WT0 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Jph4Q80WT0 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
Jph4Q80WT0 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Jph4Q80WT0 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Jph4Q80WT0 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Jph4Q80WT0 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Jph4Q80WT0 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Jph4Q80WT0 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
Jph4Q80WT0 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Jph4Q80WT0 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Jph4Q80WT0 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Jph4Q80WT0 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Jph4Q80WT0 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Jph4Q80WT0 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Jph4Q80WT0 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Jph4Q80WT0 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Jph4Q80WT0 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Jph4Q80WT0 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
Jph4Q80WT0 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Jph4Q80WT0 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Jph4Q80WT0 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Jph4Q80WT0 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Jph4Q80WT0 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Jph4Q80WT0 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Jph4Q80WT0 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Jph4Q80WT0 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Jph4Q80WT0 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Jph4Q80WT0 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Jph4Q80WT0 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Jph4Q80WT0 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
Jph4Q80WT0 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Jph4Q80WT0 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Jph4Q80WT0 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Jph4Q80WT0 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Jph4Q80WT0 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
Jph4Q80WT0 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Jph4Q80WT0 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Jph4Q80WT0 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Jph4Q80WT0 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Jph4Q80WT0 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Jph4Q80WT0 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Jph4Q80WT0 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Jph4Q80WT0 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Jph4Q80WT0 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Jph4Q80WT0 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Jph4Q80WT0 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Jph4Q80WT0 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Jph4Q80WT0 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
Jph4Q80WT0 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
Jph4Q80WT0 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Jph4Q80WT0 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
Jph4Q80WT0 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Jph4Q80WT0 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms