Protein–RNA interactions for Protein: Q80UJ7

Rab3gap1, Rab3 GTPase-activating protein catalytic subunit, mousemouse

Predictions only

Length 981 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3gap1Q80UJ7 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rab3gap1Q80UJ7 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rab3gap1Q80UJ7 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rab3gap1Q80UJ7 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rab3gap1Q80UJ7 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rab3gap1Q80UJ7 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rab3gap1Q80UJ7 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rab3gap1Q80UJ7 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rab3gap1Q80UJ7 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rab3gap1Q80UJ7 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rab3gap1Q80UJ7 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rab3gap1Q80UJ7 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rab3gap1Q80UJ7 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rab3gap1Q80UJ7 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rab3gap1Q80UJ7 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Rab3gap1Q80UJ7 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rab3gap1Q80UJ7 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rab3gap1Q80UJ7 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rab3gap1Q80UJ7 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rab3gap1Q80UJ7 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rab3gap1Q80UJ7 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rab3gap1Q80UJ7 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rab3gap1Q80UJ7 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rab3gap1Q80UJ7 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rab3gap1Q80UJ7 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Rab3gap1Q80UJ7 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rab3gap1Q80UJ7 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rab3gap1Q80UJ7 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rab3gap1Q80UJ7 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rab3gap1Q80UJ7 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rab3gap1Q80UJ7 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rab3gap1Q80UJ7 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rab3gap1Q80UJ7 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rab3gap1Q80UJ7 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rab3gap1Q80UJ7 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rab3gap1Q80UJ7 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rab3gap1Q80UJ7 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rab3gap1Q80UJ7 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rab3gap1Q80UJ7 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rab3gap1Q80UJ7 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rab3gap1Q80UJ7 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rab3gap1Q80UJ7 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rab3gap1Q80UJ7 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rab3gap1Q80UJ7 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rab3gap1Q80UJ7 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rab3gap1Q80UJ7 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rab3gap1Q80UJ7 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rab3gap1Q80UJ7 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rab3gap1Q80UJ7 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rab3gap1Q80UJ7 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rab3gap1Q80UJ7 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rab3gap1Q80UJ7 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rab3gap1Q80UJ7 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rab3gap1Q80UJ7 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rab3gap1Q80UJ7 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rab3gap1Q80UJ7 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rab3gap1Q80UJ7 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rab3gap1Q80UJ7 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rab3gap1Q80UJ7 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rab3gap1Q80UJ7 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rab3gap1Q80UJ7 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rab3gap1Q80UJ7 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rab3gap1Q80UJ7 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rab3gap1Q80UJ7 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rab3gap1Q80UJ7 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rab3gap1Q80UJ7 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rab3gap1Q80UJ7 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rab3gap1Q80UJ7 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rab3gap1Q80UJ7 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rab3gap1Q80UJ7 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rab3gap1Q80UJ7 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rab3gap1Q80UJ7 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rab3gap1Q80UJ7 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rab3gap1Q80UJ7 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Rab3gap1Q80UJ7 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rab3gap1Q80UJ7 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rab3gap1Q80UJ7 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Rab3gap1Q80UJ7 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rab3gap1Q80UJ7 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rab3gap1Q80UJ7 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rab3gap1Q80UJ7 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rab3gap1Q80UJ7 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rab3gap1Q80UJ7 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rab3gap1Q80UJ7 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rab3gap1Q80UJ7 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Rab3gap1Q80UJ7 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rab3gap1Q80UJ7 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rab3gap1Q80UJ7 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rab3gap1Q80UJ7 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rab3gap1Q80UJ7 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rab3gap1Q80UJ7 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rab3gap1Q80UJ7 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rab3gap1Q80UJ7 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rab3gap1Q80UJ7 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rab3gap1Q80UJ7 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rab3gap1Q80UJ7 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rab3gap1Q80UJ7 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rab3gap1Q80UJ7 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rab3gap1Q80UJ7 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rab3gap1Q80UJ7 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms