Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSQ1

Clec18a, C-type lectin domain family 18 member A, mousemouse

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Length 534 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec18aQ7TSQ1 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Clec18aQ7TSQ1 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Clec18aQ7TSQ1 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Clec18aQ7TSQ1 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Clec18aQ7TSQ1 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Clec18aQ7TSQ1 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Clec18aQ7TSQ1 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Clec18aQ7TSQ1 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Clec18aQ7TSQ1 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Clec18aQ7TSQ1 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Clec18aQ7TSQ1 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Clec18aQ7TSQ1 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Clec18aQ7TSQ1 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Clec18aQ7TSQ1 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Clec18aQ7TSQ1 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Clec18aQ7TSQ1 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Clec18aQ7TSQ1 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Clec18aQ7TSQ1 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Clec18aQ7TSQ1 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Clec18aQ7TSQ1 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Clec18aQ7TSQ1 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Clec18aQ7TSQ1 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Clec18aQ7TSQ1 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Clec18aQ7TSQ1 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Clec18aQ7TSQ1 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Clec18aQ7TSQ1 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Clec18aQ7TSQ1 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Clec18aQ7TSQ1 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Clec18aQ7TSQ1 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Clec18aQ7TSQ1 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Clec18aQ7TSQ1 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Clec18aQ7TSQ1 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Clec18aQ7TSQ1 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Clec18aQ7TSQ1 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Clec18aQ7TSQ1 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Clec18aQ7TSQ1 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Clec18aQ7TSQ1 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Clec18aQ7TSQ1 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Clec18aQ7TSQ1 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Clec18aQ7TSQ1 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Clec18aQ7TSQ1 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Clec18aQ7TSQ1 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Clec18aQ7TSQ1 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Clec18aQ7TSQ1 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Clec18aQ7TSQ1 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Clec18aQ7TSQ1 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Clec18aQ7TSQ1 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Clec18aQ7TSQ1 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Clec18aQ7TSQ1 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Clec18aQ7TSQ1 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Clec18aQ7TSQ1 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Clec18aQ7TSQ1 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Clec18aQ7TSQ1 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Clec18aQ7TSQ1 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Clec18aQ7TSQ1 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Clec18aQ7TSQ1 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Clec18aQ7TSQ1 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Clec18aQ7TSQ1 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Clec18aQ7TSQ1 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Clec18aQ7TSQ1 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Clec18aQ7TSQ1 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Clec18aQ7TSQ1 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Clec18aQ7TSQ1 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Clec18aQ7TSQ1 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Clec18aQ7TSQ1 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Clec18aQ7TSQ1 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Clec18aQ7TSQ1 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Clec18aQ7TSQ1 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Clec18aQ7TSQ1 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Clec18aQ7TSQ1 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Clec18aQ7TSQ1 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Clec18aQ7TSQ1 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Clec18aQ7TSQ1 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Clec18aQ7TSQ1 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Clec18aQ7TSQ1 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Clec18aQ7TSQ1 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Clec18aQ7TSQ1 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Clec18aQ7TSQ1 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Clec18aQ7TSQ1 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Clec18aQ7TSQ1 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Clec18aQ7TSQ1 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Clec18aQ7TSQ1 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Clec18aQ7TSQ1 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Clec18aQ7TSQ1 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Clec18aQ7TSQ1 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Clec18aQ7TSQ1 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Clec18aQ7TSQ1 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Clec18aQ7TSQ1 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Clec18aQ7TSQ1 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Clec18aQ7TSQ1 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Clec18aQ7TSQ1 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Clec18aQ7TSQ1 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Clec18aQ7TSQ1 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Clec18aQ7TSQ1 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Clec18aQ7TSQ1 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Clec18aQ7TSQ1 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Clec18aQ7TSQ1 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Clec18aQ7TSQ1 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Clec18aQ7TSQ1 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Clec18aQ7TSQ1 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
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