Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSN2

Clm, CMRF35-like molecule, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClmQ7TSN2 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ClmQ7TSN2 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ClmQ7TSN2 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ClmQ7TSN2 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ClmQ7TSN2 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ClmQ7TSN2 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ClmQ7TSN2 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ClmQ7TSN2 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ClmQ7TSN2 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ClmQ7TSN2 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ClmQ7TSN2 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ClmQ7TSN2 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ClmQ7TSN2 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ClmQ7TSN2 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ClmQ7TSN2 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ClmQ7TSN2 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ClmQ7TSN2 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ClmQ7TSN2 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ClmQ7TSN2 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ClmQ7TSN2 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ClmQ7TSN2 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ClmQ7TSN2 Gm13857-203ENSMUST00000150561 2337 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ClmQ7TSN2 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ClmQ7TSN2 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ClmQ7TSN2 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ClmQ7TSN2 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ClmQ7TSN2 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ClmQ7TSN2 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ClmQ7TSN2 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ClmQ7TSN2 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ClmQ7TSN2 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ClmQ7TSN2 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC16.14■□□□□ 0.18
ClmQ7TSN2 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ClmQ7TSN2 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ClmQ7TSN2 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ClmQ7TSN2 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ClmQ7TSN2 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ClmQ7TSN2 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ClmQ7TSN2 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ClmQ7TSN2 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ClmQ7TSN2 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ClmQ7TSN2 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ClmQ7TSN2 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ClmQ7TSN2 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ClmQ7TSN2 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ClmQ7TSN2 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ClmQ7TSN2 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ClmQ7TSN2 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ClmQ7TSN2 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ClmQ7TSN2 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ClmQ7TSN2 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ClmQ7TSN2 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ClmQ7TSN2 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ClmQ7TSN2 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ClmQ7TSN2 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ClmQ7TSN2 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ClmQ7TSN2 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ClmQ7TSN2 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ClmQ7TSN2 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ClmQ7TSN2 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ClmQ7TSN2 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ClmQ7TSN2 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ClmQ7TSN2 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ClmQ7TSN2 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ClmQ7TSN2 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ClmQ7TSN2 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ClmQ7TSN2 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ClmQ7TSN2 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ClmQ7TSN2 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ClmQ7TSN2 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ClmQ7TSN2 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ClmQ7TSN2 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ClmQ7TSN2 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ClmQ7TSN2 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ClmQ7TSN2 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ClmQ7TSN2 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ClmQ7TSN2 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ClmQ7TSN2 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ClmQ7TSN2 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ClmQ7TSN2 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ClmQ7TSN2 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ClmQ7TSN2 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ClmQ7TSN2 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ClmQ7TSN2 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ClmQ7TSN2 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ClmQ7TSN2 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ClmQ7TSN2 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ClmQ7TSN2 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ClmQ7TSN2 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ClmQ7TSN2 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ClmQ7TSN2 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ClmQ7TSN2 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ClmQ7TSN2 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ClmQ7TSN2 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ClmQ7TSN2 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ClmQ7TSN2 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ClmQ7TSN2 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ClmQ7TSN2 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ClmQ7TSN2 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ClmQ7TSN2 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms