Protein–RNA interactions for Protein: Q7TQK5

Ccdc93, Coiled-coil domain-containing protein 93, mousemouse

Predictions only

Length 629 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc93Q7TQK5 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc93Q7TQK5 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc93Q7TQK5 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc93Q7TQK5 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc93Q7TQK5 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc93Q7TQK5 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc93Q7TQK5 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc93Q7TQK5 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc93Q7TQK5 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc93Q7TQK5 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc93Q7TQK5 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc93Q7TQK5 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc93Q7TQK5 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc93Q7TQK5 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc93Q7TQK5 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc93Q7TQK5 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ccdc93Q7TQK5 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ccdc93Q7TQK5 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ccdc93Q7TQK5 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ccdc93Q7TQK5 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ccdc93Q7TQK5 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc93Q7TQK5 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc93Q7TQK5 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc93Q7TQK5 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc93Q7TQK5 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc93Q7TQK5 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc93Q7TQK5 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc93Q7TQK5 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc93Q7TQK5 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc93Q7TQK5 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc93Q7TQK5 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc93Q7TQK5 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc93Q7TQK5 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc93Q7TQK5 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc93Q7TQK5 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc93Q7TQK5 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc93Q7TQK5 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc93Q7TQK5 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc93Q7TQK5 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc93Q7TQK5 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc93Q7TQK5 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc93Q7TQK5 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc93Q7TQK5 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc93Q7TQK5 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc93Q7TQK5 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc93Q7TQK5 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc93Q7TQK5 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc93Q7TQK5 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc93Q7TQK5 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc93Q7TQK5 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc93Q7TQK5 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc93Q7TQK5 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc93Q7TQK5 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc93Q7TQK5 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc93Q7TQK5 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc93Q7TQK5 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc93Q7TQK5 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc93Q7TQK5 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc93Q7TQK5 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc93Q7TQK5 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc93Q7TQK5 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc93Q7TQK5 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc93Q7TQK5 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc93Q7TQK5 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc93Q7TQK5 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc93Q7TQK5 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc93Q7TQK5 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc93Q7TQK5 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc93Q7TQK5 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc93Q7TQK5 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc93Q7TQK5 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc93Q7TQK5 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc93Q7TQK5 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc93Q7TQK5 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc93Q7TQK5 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc93Q7TQK5 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc93Q7TQK5 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc93Q7TQK5 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc93Q7TQK5 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc93Q7TQK5 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc93Q7TQK5 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc93Q7TQK5 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc93Q7TQK5 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc93Q7TQK5 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc93Q7TQK5 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc93Q7TQK5 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ccdc93Q7TQK5 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ccdc93Q7TQK5 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc93Q7TQK5 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc93Q7TQK5 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc93Q7TQK5 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc93Q7TQK5 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc93Q7TQK5 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc93Q7TQK5 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc93Q7TQK5 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc93Q7TQK5 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc93Q7TQK5 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc93Q7TQK5 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc93Q7TQK5 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc93Q7TQK5 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms