Protein–RNA interactions for Protein: Q70E20

Sned1, Sushi, nidogen and EGF-like domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sned1Q70E20 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Sned1Q70E20 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sned1Q70E20 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sned1Q70E20 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sned1Q70E20 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sned1Q70E20 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sned1Q70E20 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sned1Q70E20 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sned1Q70E20 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sned1Q70E20 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Sned1Q70E20 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sned1Q70E20 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Sned1Q70E20 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Sned1Q70E20 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sned1Q70E20 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sned1Q70E20 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Sned1Q70E20 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Sned1Q70E20 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Sned1Q70E20 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Sned1Q70E20 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Sned1Q70E20 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sned1Q70E20 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sned1Q70E20 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sned1Q70E20 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Sned1Q70E20 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sned1Q70E20 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sned1Q70E20 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sned1Q70E20 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sned1Q70E20 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sned1Q70E20 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sned1Q70E20 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sned1Q70E20 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sned1Q70E20 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sned1Q70E20 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sned1Q70E20 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sned1Q70E20 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sned1Q70E20 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sned1Q70E20 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sned1Q70E20 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sned1Q70E20 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Sned1Q70E20 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sned1Q70E20 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sned1Q70E20 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sned1Q70E20 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sned1Q70E20 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sned1Q70E20 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sned1Q70E20 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Sned1Q70E20 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sned1Q70E20 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sned1Q70E20 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sned1Q70E20 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sned1Q70E20 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sned1Q70E20 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sned1Q70E20 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sned1Q70E20 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sned1Q70E20 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sned1Q70E20 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sned1Q70E20 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sned1Q70E20 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sned1Q70E20 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sned1Q70E20 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sned1Q70E20 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sned1Q70E20 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sned1Q70E20 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sned1Q70E20 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sned1Q70E20 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sned1Q70E20 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sned1Q70E20 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sned1Q70E20 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sned1Q70E20 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sned1Q70E20 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sned1Q70E20 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sned1Q70E20 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sned1Q70E20 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sned1Q70E20 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sned1Q70E20 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sned1Q70E20 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sned1Q70E20 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Sned1Q70E20 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sned1Q70E20 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sned1Q70E20 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sned1Q70E20 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sned1Q70E20 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Sned1Q70E20 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sned1Q70E20 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sned1Q70E20 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Sned1Q70E20 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sned1Q70E20 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sned1Q70E20 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sned1Q70E20 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sned1Q70E20 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Sned1Q70E20 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sned1Q70E20 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sned1Q70E20 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sned1Q70E20 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sned1Q70E20 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sned1Q70E20 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Sned1Q70E20 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Sned1Q70E20 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sned1Q70E20 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms