Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPR5

Smpd4, Sphingomyelin phosphodiesterase 4, mousemouse

Predictions only

Length 823 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpd4Q6ZPR5 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Smpd4Q6ZPR5 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Smpd4Q6ZPR5 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Smpd4Q6ZPR5 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Smpd4Q6ZPR5 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Smpd4Q6ZPR5 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Smpd4Q6ZPR5 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Smpd4Q6ZPR5 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Smpd4Q6ZPR5 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Smpd4Q6ZPR5 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Smpd4Q6ZPR5 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Smpd4Q6ZPR5 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Smpd4Q6ZPR5 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Smpd4Q6ZPR5 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Smpd4Q6ZPR5 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Smpd4Q6ZPR5 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Smpd4Q6ZPR5 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Smpd4Q6ZPR5 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Smpd4Q6ZPR5 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Smpd4Q6ZPR5 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Smpd4Q6ZPR5 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Smpd4Q6ZPR5 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Smpd4Q6ZPR5 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Smpd4Q6ZPR5 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Smpd4Q6ZPR5 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Smpd4Q6ZPR5 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Smpd4Q6ZPR5 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Smpd4Q6ZPR5 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Smpd4Q6ZPR5 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Smpd4Q6ZPR5 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Smpd4Q6ZPR5 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Smpd4Q6ZPR5 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Smpd4Q6ZPR5 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Smpd4Q6ZPR5 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Smpd4Q6ZPR5 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Smpd4Q6ZPR5 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Smpd4Q6ZPR5 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Smpd4Q6ZPR5 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Smpd4Q6ZPR5 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Smpd4Q6ZPR5 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Smpd4Q6ZPR5 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Smpd4Q6ZPR5 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Smpd4Q6ZPR5 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Smpd4Q6ZPR5 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Smpd4Q6ZPR5 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Smpd4Q6ZPR5 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Smpd4Q6ZPR5 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Smpd4Q6ZPR5 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Smpd4Q6ZPR5 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Smpd4Q6ZPR5 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Smpd4Q6ZPR5 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Smpd4Q6ZPR5 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Smpd4Q6ZPR5 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Smpd4Q6ZPR5 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Smpd4Q6ZPR5 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Smpd4Q6ZPR5 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Smpd4Q6ZPR5 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Smpd4Q6ZPR5 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Smpd4Q6ZPR5 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Smpd4Q6ZPR5 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Smpd4Q6ZPR5 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Smpd4Q6ZPR5 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Smpd4Q6ZPR5 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Smpd4Q6ZPR5 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Smpd4Q6ZPR5 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Smpd4Q6ZPR5 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Smpd4Q6ZPR5 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Smpd4Q6ZPR5 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Smpd4Q6ZPR5 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Smpd4Q6ZPR5 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Smpd4Q6ZPR5 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Smpd4Q6ZPR5 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Smpd4Q6ZPR5 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Smpd4Q6ZPR5 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Smpd4Q6ZPR5 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Smpd4Q6ZPR5 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Smpd4Q6ZPR5 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Smpd4Q6ZPR5 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Smpd4Q6ZPR5 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Smpd4Q6ZPR5 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Smpd4Q6ZPR5 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Smpd4Q6ZPR5 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Smpd4Q6ZPR5 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Smpd4Q6ZPR5 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Smpd4Q6ZPR5 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Smpd4Q6ZPR5 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Smpd4Q6ZPR5 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Smpd4Q6ZPR5 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Smpd4Q6ZPR5 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Smpd4Q6ZPR5 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Smpd4Q6ZPR5 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Smpd4Q6ZPR5 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Smpd4Q6ZPR5 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Smpd4Q6ZPR5 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Smpd4Q6ZPR5 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Smpd4Q6ZPR5 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Smpd4Q6ZPR5 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Smpd4Q6ZPR5 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Smpd4Q6ZPR5 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Smpd4Q6ZPR5 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms