Protein–RNA interactions for Protein: Q6R2P8

Neil2, Endonuclease 8-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neil2Q6R2P8 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Neil2Q6R2P8 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Neil2Q6R2P8 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Neil2Q6R2P8 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Neil2Q6R2P8 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Neil2Q6R2P8 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Neil2Q6R2P8 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Neil2Q6R2P8 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Neil2Q6R2P8 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Neil2Q6R2P8 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Neil2Q6R2P8 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Neil2Q6R2P8 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Neil2Q6R2P8 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Neil2Q6R2P8 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Neil2Q6R2P8 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Neil2Q6R2P8 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Neil2Q6R2P8 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Neil2Q6R2P8 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Neil2Q6R2P8 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Neil2Q6R2P8 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Neil2Q6R2P8 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Neil2Q6R2P8 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Neil2Q6R2P8 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Neil2Q6R2P8 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Neil2Q6R2P8 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Neil2Q6R2P8 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Neil2Q6R2P8 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Neil2Q6R2P8 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Neil2Q6R2P8 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Neil2Q6R2P8 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Neil2Q6R2P8 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Neil2Q6R2P8 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Neil2Q6R2P8 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Neil2Q6R2P8 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Neil2Q6R2P8 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Neil2Q6R2P8 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Neil2Q6R2P8 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Neil2Q6R2P8 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Neil2Q6R2P8 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Neil2Q6R2P8 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Neil2Q6R2P8 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Neil2Q6R2P8 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Neil2Q6R2P8 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Neil2Q6R2P8 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Neil2Q6R2P8 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Neil2Q6R2P8 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Neil2Q6R2P8 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Neil2Q6R2P8 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Neil2Q6R2P8 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Neil2Q6R2P8 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Neil2Q6R2P8 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Neil2Q6R2P8 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Neil2Q6R2P8 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Neil2Q6R2P8 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Neil2Q6R2P8 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Neil2Q6R2P8 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Neil2Q6R2P8 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Neil2Q6R2P8 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Neil2Q6R2P8 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Neil2Q6R2P8 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Neil2Q6R2P8 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Neil2Q6R2P8 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Neil2Q6R2P8 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Neil2Q6R2P8 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Neil2Q6R2P8 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Neil2Q6R2P8 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Neil2Q6R2P8 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Neil2Q6R2P8 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Neil2Q6R2P8 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Neil2Q6R2P8 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Neil2Q6R2P8 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Neil2Q6R2P8 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Neil2Q6R2P8 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Neil2Q6R2P8 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Neil2Q6R2P8 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Neil2Q6R2P8 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Neil2Q6R2P8 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Neil2Q6R2P8 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Neil2Q6R2P8 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Neil2Q6R2P8 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Neil2Q6R2P8 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Neil2Q6R2P8 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Neil2Q6R2P8 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Neil2Q6R2P8 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Neil2Q6R2P8 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Neil2Q6R2P8 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Neil2Q6R2P8 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Neil2Q6R2P8 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Neil2Q6R2P8 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Neil2Q6R2P8 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Neil2Q6R2P8 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Neil2Q6R2P8 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Neil2Q6R2P8 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Neil2Q6R2P8 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Neil2Q6R2P8 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Neil2Q6R2P8 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Neil2Q6R2P8 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Neil2Q6R2P8 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Neil2Q6R2P8 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Neil2Q6R2P8 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms