Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q477

Atp2b4, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2b4Q6Q477 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atp2b4Q6Q477 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atp2b4Q6Q477 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atp2b4Q6Q477 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atp2b4Q6Q477 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atp2b4Q6Q477 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atp2b4Q6Q477 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atp2b4Q6Q477 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atp2b4Q6Q477 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Atp2b4Q6Q477 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atp2b4Q6Q477 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Atp2b4Q6Q477 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Atp2b4Q6Q477 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atp2b4Q6Q477 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atp2b4Q6Q477 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atp2b4Q6Q477 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atp2b4Q6Q477 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atp2b4Q6Q477 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atp2b4Q6Q477 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atp2b4Q6Q477 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atp2b4Q6Q477 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atp2b4Q6Q477 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atp2b4Q6Q477 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Atp2b4Q6Q477 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atp2b4Q6Q477 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atp2b4Q6Q477 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atp2b4Q6Q477 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atp2b4Q6Q477 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atp2b4Q6Q477 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atp2b4Q6Q477 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atp2b4Q6Q477 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Atp2b4Q6Q477 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atp2b4Q6Q477 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atp2b4Q6Q477 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atp2b4Q6Q477 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atp2b4Q6Q477 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atp2b4Q6Q477 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atp2b4Q6Q477 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atp2b4Q6Q477 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Atp2b4Q6Q477 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atp2b4Q6Q477 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Atp2b4Q6Q477 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Atp2b4Q6Q477 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Atp2b4Q6Q477 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Atp2b4Q6Q477 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Atp2b4Q6Q477 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Atp2b4Q6Q477 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Atp2b4Q6Q477 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Atp2b4Q6Q477 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Atp2b4Q6Q477 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Atp2b4Q6Q477 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Atp2b4Q6Q477 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Atp2b4Q6Q477 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Atp2b4Q6Q477 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Atp2b4Q6Q477 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Atp2b4Q6Q477 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Atp2b4Q6Q477 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Atp2b4Q6Q477 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Atp2b4Q6Q477 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Atp2b4Q6Q477 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Atp2b4Q6Q477 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Atp2b4Q6Q477 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Atp2b4Q6Q477 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Atp2b4Q6Q477 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Atp2b4Q6Q477 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Atp2b4Q6Q477 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atp2b4Q6Q477 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atp2b4Q6Q477 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atp2b4Q6Q477 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atp2b4Q6Q477 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atp2b4Q6Q477 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Atp2b4Q6Q477 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Atp2b4Q6Q477 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atp2b4Q6Q477 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atp2b4Q6Q477 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atp2b4Q6Q477 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atp2b4Q6Q477 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atp2b4Q6Q477 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Atp2b4Q6Q477 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atp2b4Q6Q477 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atp2b4Q6Q477 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atp2b4Q6Q477 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atp2b4Q6Q477 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atp2b4Q6Q477 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Atp2b4Q6Q477 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atp2b4Q6Q477 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atp2b4Q6Q477 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atp2b4Q6Q477 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atp2b4Q6Q477 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atp2b4Q6Q477 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atp2b4Q6Q477 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atp2b4Q6Q477 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atp2b4Q6Q477 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atp2b4Q6Q477 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atp2b4Q6Q477 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atp2b4Q6Q477 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atp2b4Q6Q477 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atp2b4Q6Q477 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atp2b4Q6Q477 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Atp2b4Q6Q477 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms