Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHN1

Ccdc57, Coiled-coil domain-containing protein 57, mousemouse

Predictions only

Length 1,016 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc57Q6PHN1 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc57Q6PHN1 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc57Q6PHN1 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc57Q6PHN1 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc57Q6PHN1 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc57Q6PHN1 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc57Q6PHN1 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc57Q6PHN1 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc57Q6PHN1 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc57Q6PHN1 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ccdc57Q6PHN1 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc57Q6PHN1 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc57Q6PHN1 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc57Q6PHN1 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc57Q6PHN1 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc57Q6PHN1 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc57Q6PHN1 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc57Q6PHN1 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc57Q6PHN1 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc57Q6PHN1 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc57Q6PHN1 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc57Q6PHN1 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc57Q6PHN1 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc57Q6PHN1 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc57Q6PHN1 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc57Q6PHN1 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc57Q6PHN1 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc57Q6PHN1 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc57Q6PHN1 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc57Q6PHN1 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc57Q6PHN1 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc57Q6PHN1 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc57Q6PHN1 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc57Q6PHN1 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc57Q6PHN1 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc57Q6PHN1 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc57Q6PHN1 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc57Q6PHN1 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc57Q6PHN1 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc57Q6PHN1 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc57Q6PHN1 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc57Q6PHN1 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc57Q6PHN1 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc57Q6PHN1 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc57Q6PHN1 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc57Q6PHN1 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc57Q6PHN1 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc57Q6PHN1 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc57Q6PHN1 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc57Q6PHN1 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc57Q6PHN1 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc57Q6PHN1 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc57Q6PHN1 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc57Q6PHN1 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc57Q6PHN1 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc57Q6PHN1 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc57Q6PHN1 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc57Q6PHN1 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc57Q6PHN1 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc57Q6PHN1 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc57Q6PHN1 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc57Q6PHN1 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc57Q6PHN1 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc57Q6PHN1 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc57Q6PHN1 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc57Q6PHN1 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc57Q6PHN1 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc57Q6PHN1 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc57Q6PHN1 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc57Q6PHN1 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc57Q6PHN1 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc57Q6PHN1 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc57Q6PHN1 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc57Q6PHN1 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc57Q6PHN1 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc57Q6PHN1 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc57Q6PHN1 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc57Q6PHN1 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc57Q6PHN1 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc57Q6PHN1 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc57Q6PHN1 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc57Q6PHN1 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc57Q6PHN1 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc57Q6PHN1 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc57Q6PHN1 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc57Q6PHN1 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc57Q6PHN1 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc57Q6PHN1 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc57Q6PHN1 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc57Q6PHN1 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc57Q6PHN1 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc57Q6PHN1 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc57Q6PHN1 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ccdc57Q6PHN1 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc57Q6PHN1 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc57Q6PHN1 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc57Q6PHN1 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc57Q6PHN1 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc57Q6PHN1 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc57Q6PHN1 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms