Protein–RNA interactions for Protein: Q6PG04

Ccdc82, Coiled-coil domain-containing protein 82, mousemouse

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc82Q6PG04 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc82Q6PG04 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc82Q6PG04 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc82Q6PG04 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc82Q6PG04 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc82Q6PG04 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc82Q6PG04 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc82Q6PG04 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc82Q6PG04 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc82Q6PG04 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc82Q6PG04 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc82Q6PG04 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc82Q6PG04 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc82Q6PG04 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc82Q6PG04 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc82Q6PG04 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc82Q6PG04 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc82Q6PG04 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc82Q6PG04 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc82Q6PG04 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc82Q6PG04 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc82Q6PG04 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc82Q6PG04 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc82Q6PG04 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc82Q6PG04 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc82Q6PG04 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc82Q6PG04 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc82Q6PG04 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc82Q6PG04 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc82Q6PG04 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc82Q6PG04 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc82Q6PG04 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc82Q6PG04 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc82Q6PG04 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc82Q6PG04 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc82Q6PG04 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc82Q6PG04 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc82Q6PG04 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc82Q6PG04 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc82Q6PG04 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc82Q6PG04 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc82Q6PG04 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc82Q6PG04 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc82Q6PG04 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc82Q6PG04 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc82Q6PG04 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc82Q6PG04 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc82Q6PG04 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc82Q6PG04 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc82Q6PG04 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc82Q6PG04 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc82Q6PG04 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc82Q6PG04 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc82Q6PG04 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc82Q6PG04 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc82Q6PG04 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc82Q6PG04 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc82Q6PG04 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ccdc82Q6PG04 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Ccdc82Q6PG04 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc82Q6PG04 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc82Q6PG04 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc82Q6PG04 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc82Q6PG04 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc82Q6PG04 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc82Q6PG04 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc82Q6PG04 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc82Q6PG04 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc82Q6PG04 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc82Q6PG04 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc82Q6PG04 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc82Q6PG04 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc82Q6PG04 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc82Q6PG04 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc82Q6PG04 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc82Q6PG04 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc82Q6PG04 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc82Q6PG04 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc82Q6PG04 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc82Q6PG04 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc82Q6PG04 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc82Q6PG04 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc82Q6PG04 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc82Q6PG04 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc82Q6PG04 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc82Q6PG04 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc82Q6PG04 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc82Q6PG04 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc82Q6PG04 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc82Q6PG04 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc82Q6PG04 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc82Q6PG04 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc82Q6PG04 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc82Q6PG04 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc82Q6PG04 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc82Q6PG04 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc82Q6PG04 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc82Q6PG04 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc82Q6PG04 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc82Q6PG04 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms