Protein–RNA interactions for Protein: Q6P8N9

Cyp2d40, Cytochrome P450, family 2, subfamily d, polypeptide 40, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp2d40Q6P8N9 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cyp2d40Q6P8N9 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cyp2d40Q6P8N9 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cyp2d40Q6P8N9 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cyp2d40Q6P8N9 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cyp2d40Q6P8N9 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cyp2d40Q6P8N9 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cyp2d40Q6P8N9 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cyp2d40Q6P8N9 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cyp2d40Q6P8N9 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cyp2d40Q6P8N9 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cyp2d40Q6P8N9 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cyp2d40Q6P8N9 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cyp2d40Q6P8N9 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cyp2d40Q6P8N9 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cyp2d40Q6P8N9 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cyp2d40Q6P8N9 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cyp2d40Q6P8N9 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cyp2d40Q6P8N9 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cyp2d40Q6P8N9 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cyp2d40Q6P8N9 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cyp2d40Q6P8N9 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cyp2d40Q6P8N9 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cyp2d40Q6P8N9 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cyp2d40Q6P8N9 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cyp2d40Q6P8N9 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cyp2d40Q6P8N9 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cyp2d40Q6P8N9 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cyp2d40Q6P8N9 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cyp2d40Q6P8N9 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cyp2d40Q6P8N9 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cyp2d40Q6P8N9 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cyp2d40Q6P8N9 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cyp2d40Q6P8N9 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cyp2d40Q6P8N9 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cyp2d40Q6P8N9 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cyp2d40Q6P8N9 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cyp2d40Q6P8N9 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cyp2d40Q6P8N9 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cyp2d40Q6P8N9 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cyp2d40Q6P8N9 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cyp2d40Q6P8N9 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cyp2d40Q6P8N9 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cyp2d40Q6P8N9 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cyp2d40Q6P8N9 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cyp2d40Q6P8N9 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cyp2d40Q6P8N9 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cyp2d40Q6P8N9 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cyp2d40Q6P8N9 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cyp2d40Q6P8N9 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cyp2d40Q6P8N9 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cyp2d40Q6P8N9 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cyp2d40Q6P8N9 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cyp2d40Q6P8N9 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cyp2d40Q6P8N9 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cyp2d40Q6P8N9 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cyp2d40Q6P8N9 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cyp2d40Q6P8N9 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cyp2d40Q6P8N9 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cyp2d40Q6P8N9 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cyp2d40Q6P8N9 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cyp2d40Q6P8N9 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cyp2d40Q6P8N9 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cyp2d40Q6P8N9 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cyp2d40Q6P8N9 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cyp2d40Q6P8N9 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cyp2d40Q6P8N9 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cyp2d40Q6P8N9 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cyp2d40Q6P8N9 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cyp2d40Q6P8N9 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Cyp2d40Q6P8N9 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cyp2d40Q6P8N9 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cyp2d40Q6P8N9 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cyp2d40Q6P8N9 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cyp2d40Q6P8N9 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cyp2d40Q6P8N9 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cyp2d40Q6P8N9 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cyp2d40Q6P8N9 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cyp2d40Q6P8N9 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cyp2d40Q6P8N9 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cyp2d40Q6P8N9 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cyp2d40Q6P8N9 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cyp2d40Q6P8N9 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cyp2d40Q6P8N9 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cyp2d40Q6P8N9 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cyp2d40Q6P8N9 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cyp2d40Q6P8N9 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cyp2d40Q6P8N9 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cyp2d40Q6P8N9 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cyp2d40Q6P8N9 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cyp2d40Q6P8N9 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cyp2d40Q6P8N9 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cyp2d40Q6P8N9 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cyp2d40Q6P8N9 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cyp2d40Q6P8N9 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cyp2d40Q6P8N9 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cyp2d40Q6P8N9 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cyp2d40Q6P8N9 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cyp2d40Q6P8N9 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cyp2d40Q6P8N9 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms