Protein–RNA interactions for Protein: Q6P4S6

Sik3, Serine/threonine-protein kinase SIK3, mousemouse

Predictions only

Length 1,311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sik3Q6P4S6 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sik3Q6P4S6 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Sik3Q6P4S6 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sik3Q6P4S6 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Sik3Q6P4S6 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sik3Q6P4S6 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sik3Q6P4S6 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sik3Q6P4S6 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sik3Q6P4S6 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sik3Q6P4S6 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sik3Q6P4S6 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sik3Q6P4S6 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Sik3Q6P4S6 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sik3Q6P4S6 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sik3Q6P4S6 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sik3Q6P4S6 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sik3Q6P4S6 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sik3Q6P4S6 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sik3Q6P4S6 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sik3Q6P4S6 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sik3Q6P4S6 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sik3Q6P4S6 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Sik3Q6P4S6 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sik3Q6P4S6 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sik3Q6P4S6 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sik3Q6P4S6 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sik3Q6P4S6 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sik3Q6P4S6 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Sik3Q6P4S6 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sik3Q6P4S6 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sik3Q6P4S6 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Sik3Q6P4S6 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Sik3Q6P4S6 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Sik3Q6P4S6 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Sik3Q6P4S6 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Sik3Q6P4S6 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Sik3Q6P4S6 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sik3Q6P4S6 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sik3Q6P4S6 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sik3Q6P4S6 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Sik3Q6P4S6 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sik3Q6P4S6 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sik3Q6P4S6 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sik3Q6P4S6 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sik3Q6P4S6 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sik3Q6P4S6 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sik3Q6P4S6 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Sik3Q6P4S6 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sik3Q6P4S6 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sik3Q6P4S6 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sik3Q6P4S6 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sik3Q6P4S6 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sik3Q6P4S6 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sik3Q6P4S6 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Sik3Q6P4S6 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sik3Q6P4S6 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sik3Q6P4S6 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sik3Q6P4S6 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Sik3Q6P4S6 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sik3Q6P4S6 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sik3Q6P4S6 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sik3Q6P4S6 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sik3Q6P4S6 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sik3Q6P4S6 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sik3Q6P4S6 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sik3Q6P4S6 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sik3Q6P4S6 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sik3Q6P4S6 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sik3Q6P4S6 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sik3Q6P4S6 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sik3Q6P4S6 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sik3Q6P4S6 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sik3Q6P4S6 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sik3Q6P4S6 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sik3Q6P4S6 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Sik3Q6P4S6 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sik3Q6P4S6 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sik3Q6P4S6 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sik3Q6P4S6 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sik3Q6P4S6 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sik3Q6P4S6 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sik3Q6P4S6 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sik3Q6P4S6 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sik3Q6P4S6 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sik3Q6P4S6 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sik3Q6P4S6 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sik3Q6P4S6 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sik3Q6P4S6 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sik3Q6P4S6 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sik3Q6P4S6 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sik3Q6P4S6 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sik3Q6P4S6 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sik3Q6P4S6 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sik3Q6P4S6 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sik3Q6P4S6 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sik3Q6P4S6 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sik3Q6P4S6 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sik3Q6P4S6 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sik3Q6P4S6 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sik3Q6P4S6 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms