Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZN1

Pprc1, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,644 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pprc1Q6NZN1 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Pprc1Q6NZN1 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Pprc1Q6NZN1 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Pprc1Q6NZN1 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Pprc1Q6NZN1 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Pprc1Q6NZN1 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Pprc1Q6NZN1 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Pprc1Q6NZN1 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Pprc1Q6NZN1 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Pprc1Q6NZN1 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Pprc1Q6NZN1 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Pprc1Q6NZN1 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Pprc1Q6NZN1 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Pprc1Q6NZN1 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Pprc1Q6NZN1 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Pprc1Q6NZN1 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Pprc1Q6NZN1 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Pprc1Q6NZN1 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Pprc1Q6NZN1 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Pprc1Q6NZN1 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Pprc1Q6NZN1 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Pprc1Q6NZN1 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Pprc1Q6NZN1 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Pprc1Q6NZN1 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Pprc1Q6NZN1 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Pprc1Q6NZN1 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Pprc1Q6NZN1 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Pprc1Q6NZN1 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Pprc1Q6NZN1 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Pprc1Q6NZN1 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Pprc1Q6NZN1 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Pprc1Q6NZN1 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Pprc1Q6NZN1 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Pprc1Q6NZN1 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Pprc1Q6NZN1 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Pprc1Q6NZN1 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Pprc1Q6NZN1 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Pprc1Q6NZN1 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Pprc1Q6NZN1 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Pprc1Q6NZN1 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Pprc1Q6NZN1 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Pprc1Q6NZN1 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Pprc1Q6NZN1 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Pprc1Q6NZN1 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
Pprc1Q6NZN1 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Pprc1Q6NZN1 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Pprc1Q6NZN1 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Pprc1Q6NZN1 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Pprc1Q6NZN1 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Pprc1Q6NZN1 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
Pprc1Q6NZN1 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Pprc1Q6NZN1 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Pprc1Q6NZN1 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Pprc1Q6NZN1 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Pprc1Q6NZN1 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Pprc1Q6NZN1 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Pprc1Q6NZN1 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Pprc1Q6NZN1 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Pprc1Q6NZN1 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Pprc1Q6NZN1 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Pprc1Q6NZN1 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Pprc1Q6NZN1 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Pprc1Q6NZN1 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Pprc1Q6NZN1 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Pprc1Q6NZN1 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Pprc1Q6NZN1 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Pprc1Q6NZN1 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Pprc1Q6NZN1 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Pprc1Q6NZN1 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Pprc1Q6NZN1 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
Pprc1Q6NZN1 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Pprc1Q6NZN1 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Pprc1Q6NZN1 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Pprc1Q6NZN1 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Pprc1Q6NZN1 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Pprc1Q6NZN1 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Pprc1Q6NZN1 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Pprc1Q6NZN1 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Pprc1Q6NZN1 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
Pprc1Q6NZN1 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Pprc1Q6NZN1 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Pprc1Q6NZN1 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Pprc1Q6NZN1 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Pprc1Q6NZN1 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Pprc1Q6NZN1 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Pprc1Q6NZN1 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Pprc1Q6NZN1 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Pprc1Q6NZN1 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Pprc1Q6NZN1 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Pprc1Q6NZN1 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Pprc1Q6NZN1 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Pprc1Q6NZN1 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Pprc1Q6NZN1 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Pprc1Q6NZN1 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Pprc1Q6NZN1 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Pprc1Q6NZN1 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Pprc1Q6NZN1 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Pprc1Q6NZN1 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Pprc1Q6NZN1 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Pprc1Q6NZN1 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms