Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZL0

Soga3, Protein SOGA3, mousemouse

Predictions only

Length 945 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Soga3Q6NZL0 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Soga3Q6NZL0 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Soga3Q6NZL0 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Soga3Q6NZL0 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Soga3Q6NZL0 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Soga3Q6NZL0 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Soga3Q6NZL0 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Soga3Q6NZL0 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Soga3Q6NZL0 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Soga3Q6NZL0 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Soga3Q6NZL0 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Soga3Q6NZL0 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Soga3Q6NZL0 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Soga3Q6NZL0 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Soga3Q6NZL0 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Soga3Q6NZL0 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Soga3Q6NZL0 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Soga3Q6NZL0 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Soga3Q6NZL0 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Soga3Q6NZL0 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Soga3Q6NZL0 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Soga3Q6NZL0 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Soga3Q6NZL0 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Soga3Q6NZL0 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Soga3Q6NZL0 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Soga3Q6NZL0 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Soga3Q6NZL0 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Soga3Q6NZL0 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Soga3Q6NZL0 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Soga3Q6NZL0 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Soga3Q6NZL0 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Soga3Q6NZL0 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Soga3Q6NZL0 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Soga3Q6NZL0 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Soga3Q6NZL0 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Soga3Q6NZL0 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Soga3Q6NZL0 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Soga3Q6NZL0 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Soga3Q6NZL0 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Soga3Q6NZL0 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Soga3Q6NZL0 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Soga3Q6NZL0 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Soga3Q6NZL0 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Soga3Q6NZL0 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Soga3Q6NZL0 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Soga3Q6NZL0 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Soga3Q6NZL0 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Soga3Q6NZL0 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Soga3Q6NZL0 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Soga3Q6NZL0 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Soga3Q6NZL0 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Soga3Q6NZL0 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Soga3Q6NZL0 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Soga3Q6NZL0 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Soga3Q6NZL0 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Soga3Q6NZL0 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Soga3Q6NZL0 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Soga3Q6NZL0 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Soga3Q6NZL0 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Soga3Q6NZL0 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Soga3Q6NZL0 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Soga3Q6NZL0 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Soga3Q6NZL0 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Soga3Q6NZL0 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Soga3Q6NZL0 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Soga3Q6NZL0 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Soga3Q6NZL0 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Soga3Q6NZL0 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Soga3Q6NZL0 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Soga3Q6NZL0 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Soga3Q6NZL0 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Soga3Q6NZL0 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Soga3Q6NZL0 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Soga3Q6NZL0 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Soga3Q6NZL0 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Soga3Q6NZL0 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Soga3Q6NZL0 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Soga3Q6NZL0 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Soga3Q6NZL0 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Soga3Q6NZL0 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Soga3Q6NZL0 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Soga3Q6NZL0 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Soga3Q6NZL0 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Soga3Q6NZL0 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Soga3Q6NZL0 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Soga3Q6NZL0 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Soga3Q6NZL0 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Soga3Q6NZL0 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Soga3Q6NZL0 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Soga3Q6NZL0 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Soga3Q6NZL0 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Soga3Q6NZL0 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Soga3Q6NZL0 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Soga3Q6NZL0 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Soga3Q6NZL0 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Soga3Q6NZL0 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Soga3Q6NZL0 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Soga3Q6NZL0 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Soga3Q6NZL0 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Soga3Q6NZL0 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms