Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVF9

Cpsf6, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpsf6Q6NVF9 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cpsf6Q6NVF9 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cpsf6Q6NVF9 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cpsf6Q6NVF9 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cpsf6Q6NVF9 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cpsf6Q6NVF9 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Cpsf6Q6NVF9 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Cpsf6Q6NVF9 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cpsf6Q6NVF9 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cpsf6Q6NVF9 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Cpsf6Q6NVF9 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cpsf6Q6NVF9 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cpsf6Q6NVF9 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Cpsf6Q6NVF9 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Cpsf6Q6NVF9 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cpsf6Q6NVF9 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cpsf6Q6NVF9 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cpsf6Q6NVF9 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cpsf6Q6NVF9 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cpsf6Q6NVF9 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cpsf6Q6NVF9 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cpsf6Q6NVF9 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cpsf6Q6NVF9 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cpsf6Q6NVF9 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cpsf6Q6NVF9 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cpsf6Q6NVF9 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cpsf6Q6NVF9 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cpsf6Q6NVF9 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cpsf6Q6NVF9 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cpsf6Q6NVF9 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cpsf6Q6NVF9 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cpsf6Q6NVF9 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cpsf6Q6NVF9 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cpsf6Q6NVF9 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cpsf6Q6NVF9 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cpsf6Q6NVF9 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cpsf6Q6NVF9 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cpsf6Q6NVF9 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cpsf6Q6NVF9 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cpsf6Q6NVF9 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cpsf6Q6NVF9 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cpsf6Q6NVF9 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cpsf6Q6NVF9 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cpsf6Q6NVF9 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cpsf6Q6NVF9 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cpsf6Q6NVF9 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Cpsf6Q6NVF9 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Cpsf6Q6NVF9 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Cpsf6Q6NVF9 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cpsf6Q6NVF9 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cpsf6Q6NVF9 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cpsf6Q6NVF9 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cpsf6Q6NVF9 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cpsf6Q6NVF9 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cpsf6Q6NVF9 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cpsf6Q6NVF9 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Cpsf6Q6NVF9 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cpsf6Q6NVF9 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cpsf6Q6NVF9 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cpsf6Q6NVF9 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Cpsf6Q6NVF9 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cpsf6Q6NVF9 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cpsf6Q6NVF9 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cpsf6Q6NVF9 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cpsf6Q6NVF9 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cpsf6Q6NVF9 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cpsf6Q6NVF9 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cpsf6Q6NVF9 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cpsf6Q6NVF9 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cpsf6Q6NVF9 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cpsf6Q6NVF9 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cpsf6Q6NVF9 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cpsf6Q6NVF9 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cpsf6Q6NVF9 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cpsf6Q6NVF9 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cpsf6Q6NVF9 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cpsf6Q6NVF9 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Cpsf6Q6NVF9 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cpsf6Q6NVF9 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cpsf6Q6NVF9 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cpsf6Q6NVF9 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cpsf6Q6NVF9 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Cpsf6Q6NVF9 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cpsf6Q6NVF9 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cpsf6Q6NVF9 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cpsf6Q6NVF9 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cpsf6Q6NVF9 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cpsf6Q6NVF9 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cpsf6Q6NVF9 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cpsf6Q6NVF9 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cpsf6Q6NVF9 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cpsf6Q6NVF9 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cpsf6Q6NVF9 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cpsf6Q6NVF9 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cpsf6Q6NVF9 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cpsf6Q6NVF9 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cpsf6Q6NVF9 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cpsf6Q6NVF9 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cpsf6Q6NVF9 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cpsf6Q6NVF9 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms