Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVE8

Wdr44, WD repeat-containing protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 915 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr44Q6NVE8 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Wdr44Q6NVE8 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Wdr44Q6NVE8 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Wdr44Q6NVE8 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Wdr44Q6NVE8 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Wdr44Q6NVE8 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Wdr44Q6NVE8 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Wdr44Q6NVE8 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Wdr44Q6NVE8 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Wdr44Q6NVE8 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Wdr44Q6NVE8 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Wdr44Q6NVE8 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Wdr44Q6NVE8 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Wdr44Q6NVE8 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Wdr44Q6NVE8 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Wdr44Q6NVE8 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Wdr44Q6NVE8 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Wdr44Q6NVE8 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Wdr44Q6NVE8 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Wdr44Q6NVE8 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Wdr44Q6NVE8 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Wdr44Q6NVE8 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Wdr44Q6NVE8 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Wdr44Q6NVE8 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Wdr44Q6NVE8 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Wdr44Q6NVE8 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Wdr44Q6NVE8 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Wdr44Q6NVE8 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Wdr44Q6NVE8 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Wdr44Q6NVE8 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Wdr44Q6NVE8 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Wdr44Q6NVE8 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Wdr44Q6NVE8 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Wdr44Q6NVE8 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Wdr44Q6NVE8 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Wdr44Q6NVE8 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Wdr44Q6NVE8 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Wdr44Q6NVE8 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Wdr44Q6NVE8 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Wdr44Q6NVE8 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Wdr44Q6NVE8 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Wdr44Q6NVE8 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Wdr44Q6NVE8 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Wdr44Q6NVE8 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Wdr44Q6NVE8 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Wdr44Q6NVE8 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Wdr44Q6NVE8 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Wdr44Q6NVE8 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Wdr44Q6NVE8 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Wdr44Q6NVE8 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Wdr44Q6NVE8 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Wdr44Q6NVE8 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Wdr44Q6NVE8 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Wdr44Q6NVE8 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Wdr44Q6NVE8 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Wdr44Q6NVE8 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Wdr44Q6NVE8 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Wdr44Q6NVE8 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Wdr44Q6NVE8 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Wdr44Q6NVE8 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Wdr44Q6NVE8 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Wdr44Q6NVE8 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Wdr44Q6NVE8 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Wdr44Q6NVE8 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Wdr44Q6NVE8 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Wdr44Q6NVE8 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Wdr44Q6NVE8 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Wdr44Q6NVE8 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Wdr44Q6NVE8 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Wdr44Q6NVE8 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Wdr44Q6NVE8 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Wdr44Q6NVE8 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Wdr44Q6NVE8 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Wdr44Q6NVE8 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Wdr44Q6NVE8 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Wdr44Q6NVE8 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Wdr44Q6NVE8 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Wdr44Q6NVE8 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Wdr44Q6NVE8 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Wdr44Q6NVE8 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Wdr44Q6NVE8 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Wdr44Q6NVE8 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Wdr44Q6NVE8 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Wdr44Q6NVE8 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Wdr44Q6NVE8 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Wdr44Q6NVE8 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Wdr44Q6NVE8 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Wdr44Q6NVE8 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Wdr44Q6NVE8 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Wdr44Q6NVE8 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Wdr44Q6NVE8 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Wdr44Q6NVE8 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Wdr44Q6NVE8 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Wdr44Q6NVE8 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Wdr44Q6NVE8 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Wdr44Q6NVE8 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Wdr44Q6NVE8 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Wdr44Q6NVE8 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Wdr44Q6NVE8 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Wdr44Q6NVE8 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms