Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSW3

Sphkap, A-kinase anchor protein SPHKAP, mousemouse

Predictions only

Length 1,687 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SphkapQ6NSW3 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SphkapQ6NSW3 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SphkapQ6NSW3 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SphkapQ6NSW3 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SphkapQ6NSW3 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SphkapQ6NSW3 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SphkapQ6NSW3 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SphkapQ6NSW3 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SphkapQ6NSW3 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
SphkapQ6NSW3 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SphkapQ6NSW3 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SphkapQ6NSW3 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SphkapQ6NSW3 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SphkapQ6NSW3 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SphkapQ6NSW3 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
SphkapQ6NSW3 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SphkapQ6NSW3 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
SphkapQ6NSW3 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SphkapQ6NSW3 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SphkapQ6NSW3 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SphkapQ6NSW3 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SphkapQ6NSW3 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SphkapQ6NSW3 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
SphkapQ6NSW3 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SphkapQ6NSW3 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SphkapQ6NSW3 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
SphkapQ6NSW3 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SphkapQ6NSW3 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SphkapQ6NSW3 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SphkapQ6NSW3 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SphkapQ6NSW3 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SphkapQ6NSW3 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SphkapQ6NSW3 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SphkapQ6NSW3 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SphkapQ6NSW3 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SphkapQ6NSW3 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SphkapQ6NSW3 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SphkapQ6NSW3 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SphkapQ6NSW3 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SphkapQ6NSW3 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SphkapQ6NSW3 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SphkapQ6NSW3 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
SphkapQ6NSW3 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
SphkapQ6NSW3 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
SphkapQ6NSW3 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SphkapQ6NSW3 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SphkapQ6NSW3 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SphkapQ6NSW3 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SphkapQ6NSW3 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SphkapQ6NSW3 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SphkapQ6NSW3 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SphkapQ6NSW3 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SphkapQ6NSW3 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SphkapQ6NSW3 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SphkapQ6NSW3 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SphkapQ6NSW3 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SphkapQ6NSW3 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SphkapQ6NSW3 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SphkapQ6NSW3 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SphkapQ6NSW3 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SphkapQ6NSW3 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SphkapQ6NSW3 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SphkapQ6NSW3 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SphkapQ6NSW3 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
SphkapQ6NSW3 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SphkapQ6NSW3 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SphkapQ6NSW3 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SphkapQ6NSW3 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SphkapQ6NSW3 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SphkapQ6NSW3 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SphkapQ6NSW3 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
SphkapQ6NSW3 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SphkapQ6NSW3 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SphkapQ6NSW3 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SphkapQ6NSW3 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SphkapQ6NSW3 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
SphkapQ6NSW3 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SphkapQ6NSW3 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
SphkapQ6NSW3 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SphkapQ6NSW3 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SphkapQ6NSW3 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SphkapQ6NSW3 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SphkapQ6NSW3 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SphkapQ6NSW3 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SphkapQ6NSW3 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SphkapQ6NSW3 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SphkapQ6NSW3 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SphkapQ6NSW3 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
SphkapQ6NSW3 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SphkapQ6NSW3 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SphkapQ6NSW3 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SphkapQ6NSW3 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SphkapQ6NSW3 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SphkapQ6NSW3 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
SphkapQ6NSW3 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
SphkapQ6NSW3 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
SphkapQ6NSW3 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
SphkapQ6NSW3 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SphkapQ6NSW3 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
SphkapQ6NSW3 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms