Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFT4

Arhgap20, Rho GTPase-activating protein 20, mousemouse

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgap20Q6IFT4 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Arhgap20Q6IFT4 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Arhgap20Q6IFT4 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Arhgap20Q6IFT4 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Arhgap20Q6IFT4 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Arhgap20Q6IFT4 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Arhgap20Q6IFT4 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Arhgap20Q6IFT4 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Arhgap20Q6IFT4 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Arhgap20Q6IFT4 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Arhgap20Q6IFT4 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Arhgap20Q6IFT4 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Arhgap20Q6IFT4 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Arhgap20Q6IFT4 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Arhgap20Q6IFT4 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Arhgap20Q6IFT4 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Arhgap20Q6IFT4 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Arhgap20Q6IFT4 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Arhgap20Q6IFT4 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Arhgap20Q6IFT4 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Arhgap20Q6IFT4 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Arhgap20Q6IFT4 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Arhgap20Q6IFT4 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Arhgap20Q6IFT4 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Arhgap20Q6IFT4 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Arhgap20Q6IFT4 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Arhgap20Q6IFT4 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Arhgap20Q6IFT4 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Arhgap20Q6IFT4 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Arhgap20Q6IFT4 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Arhgap20Q6IFT4 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Arhgap20Q6IFT4 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Arhgap20Q6IFT4 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Arhgap20Q6IFT4 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Arhgap20Q6IFT4 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Arhgap20Q6IFT4 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Arhgap20Q6IFT4 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Arhgap20Q6IFT4 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Arhgap20Q6IFT4 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Arhgap20Q6IFT4 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Arhgap20Q6IFT4 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Arhgap20Q6IFT4 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Arhgap20Q6IFT4 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Arhgap20Q6IFT4 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Arhgap20Q6IFT4 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Arhgap20Q6IFT4 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Arhgap20Q6IFT4 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Arhgap20Q6IFT4 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Arhgap20Q6IFT4 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Arhgap20Q6IFT4 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Arhgap20Q6IFT4 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Arhgap20Q6IFT4 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Arhgap20Q6IFT4 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Arhgap20Q6IFT4 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Arhgap20Q6IFT4 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Arhgap20Q6IFT4 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Arhgap20Q6IFT4 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Arhgap20Q6IFT4 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Arhgap20Q6IFT4 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Arhgap20Q6IFT4 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Arhgap20Q6IFT4 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Arhgap20Q6IFT4 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Arhgap20Q6IFT4 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Arhgap20Q6IFT4 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Arhgap20Q6IFT4 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Arhgap20Q6IFT4 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Arhgap20Q6IFT4 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Arhgap20Q6IFT4 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Arhgap20Q6IFT4 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Arhgap20Q6IFT4 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Arhgap20Q6IFT4 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Arhgap20Q6IFT4 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Arhgap20Q6IFT4 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Arhgap20Q6IFT4 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Arhgap20Q6IFT4 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Arhgap20Q6IFT4 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Arhgap20Q6IFT4 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Arhgap20Q6IFT4 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Arhgap20Q6IFT4 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Arhgap20Q6IFT4 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Arhgap20Q6IFT4 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Arhgap20Q6IFT4 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Arhgap20Q6IFT4 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Arhgap20Q6IFT4 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Arhgap20Q6IFT4 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Arhgap20Q6IFT4 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Arhgap20Q6IFT4 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Arhgap20Q6IFT4 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Arhgap20Q6IFT4 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Arhgap20Q6IFT4 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Arhgap20Q6IFT4 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Arhgap20Q6IFT4 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Arhgap20Q6IFT4 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Arhgap20Q6IFT4 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Arhgap20Q6IFT4 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Arhgap20Q6IFT4 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Arhgap20Q6IFT4 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Arhgap20Q6IFT4 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Arhgap20Q6IFT4 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Arhgap20Q6IFT4 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms