Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW0

Guanine nucleotide exchange C9orf72 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6DFW0 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Q6DFW0 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Q6DFW0 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Q6DFW0 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Q6DFW0 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Q6DFW0 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Q6DFW0 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Q6DFW0 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Q6DFW0 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Q6DFW0 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Q6DFW0 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Q6DFW0 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Q6DFW0 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
Q6DFW0 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Q6DFW0 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Q6DFW0 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Q6DFW0 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Q6DFW0 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Q6DFW0 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Q6DFW0 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Q6DFW0 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Q6DFW0 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Q6DFW0 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Q6DFW0 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Q6DFW0 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Q6DFW0 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Q6DFW0 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Q6DFW0 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Q6DFW0 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Q6DFW0 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Q6DFW0 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Q6DFW0 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Q6DFW0 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Q6DFW0 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Q6DFW0 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Q6DFW0 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Q6DFW0 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Q6DFW0 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Q6DFW0 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Q6DFW0 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Q6DFW0 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Q6DFW0 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Q6DFW0 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Q6DFW0 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Q6DFW0 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Q6DFW0 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Q6DFW0 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Q6DFW0 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Q6DFW0 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Q6DFW0 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Q6DFW0 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Q6DFW0 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Q6DFW0 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Q6DFW0 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Q6DFW0 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Q6DFW0 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Q6DFW0 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Q6DFW0 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Q6DFW0 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Q6DFW0 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Q6DFW0 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Q6DFW0 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Q6DFW0 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Q6DFW0 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Q6DFW0 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Q6DFW0 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Q6DFW0 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Q6DFW0 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Q6DFW0 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Q6DFW0 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Q6DFW0 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Q6DFW0 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Q6DFW0 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Q6DFW0 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Q6DFW0 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Q6DFW0 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Q6DFW0 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Q6DFW0 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Q6DFW0 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Q6DFW0 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Q6DFW0 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Q6DFW0 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Q6DFW0 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Q6DFW0 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Q6DFW0 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Q6DFW0 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Q6DFW0 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Q6DFW0 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Q6DFW0 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Q6DFW0 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Q6DFW0 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Q6DFW0 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Q6DFW0 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Q6DFW0 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Q6DFW0 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Q6DFW0 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Q6DFW0 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Q6DFW0 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Q6DFW0 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Q6DFW0 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64 ms