Protein–RNA interactions for Protein: Q6A078

Cep290, Centrosomal protein of 290 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep290Q6A078 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cep290Q6A078 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cep290Q6A078 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cep290Q6A078 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cep290Q6A078 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cep290Q6A078 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cep290Q6A078 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cep290Q6A078 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cep290Q6A078 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cep290Q6A078 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Cep290Q6A078 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Cep290Q6A078 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cep290Q6A078 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cep290Q6A078 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cep290Q6A078 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cep290Q6A078 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cep290Q6A078 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cep290Q6A078 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cep290Q6A078 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cep290Q6A078 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cep290Q6A078 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cep290Q6A078 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cep290Q6A078 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cep290Q6A078 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cep290Q6A078 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cep290Q6A078 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cep290Q6A078 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cep290Q6A078 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cep290Q6A078 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cep290Q6A078 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cep290Q6A078 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cep290Q6A078 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Cep290Q6A078 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cep290Q6A078 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cep290Q6A078 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cep290Q6A078 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cep290Q6A078 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cep290Q6A078 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cep290Q6A078 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cep290Q6A078 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Cep290Q6A078 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cep290Q6A078 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cep290Q6A078 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cep290Q6A078 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cep290Q6A078 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cep290Q6A078 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cep290Q6A078 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Cep290Q6A078 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cep290Q6A078 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cep290Q6A078 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cep290Q6A078 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cep290Q6A078 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cep290Q6A078 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cep290Q6A078 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cep290Q6A078 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cep290Q6A078 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cep290Q6A078 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cep290Q6A078 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Cep290Q6A078 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cep290Q6A078 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cep290Q6A078 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cep290Q6A078 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cep290Q6A078 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Cep290Q6A078 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cep290Q6A078 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cep290Q6A078 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cep290Q6A078 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cep290Q6A078 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cep290Q6A078 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cep290Q6A078 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cep290Q6A078 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cep290Q6A078 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Cep290Q6A078 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cep290Q6A078 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cep290Q6A078 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cep290Q6A078 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cep290Q6A078 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cep290Q6A078 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cep290Q6A078 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cep290Q6A078 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Cep290Q6A078 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cep290Q6A078 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cep290Q6A078 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cep290Q6A078 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Cep290Q6A078 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cep290Q6A078 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cep290Q6A078 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Cep290Q6A078 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cep290Q6A078 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cep290Q6A078 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cep290Q6A078 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Cep290Q6A078 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cep290Q6A078 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Cep290Q6A078 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Cep290Q6A078 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cep290Q6A078 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cep290Q6A078 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cep290Q6A078 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cep290Q6A078 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cep290Q6A078 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms