Protein–RNA interactions for Protein: Q6A009

Ltn1, E3 ubiquitin-protein ligase listerin, mousemouse

Predictions only

Length 1,767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ltn1Q6A009 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ltn1Q6A009 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ltn1Q6A009 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ltn1Q6A009 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ltn1Q6A009 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ltn1Q6A009 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ltn1Q6A009 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ltn1Q6A009 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ltn1Q6A009 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ltn1Q6A009 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ltn1Q6A009 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ltn1Q6A009 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ltn1Q6A009 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Ltn1Q6A009 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Ltn1Q6A009 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ltn1Q6A009 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ltn1Q6A009 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ltn1Q6A009 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ltn1Q6A009 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ltn1Q6A009 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ltn1Q6A009 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ltn1Q6A009 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ltn1Q6A009 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Ltn1Q6A009 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ltn1Q6A009 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ltn1Q6A009 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ltn1Q6A009 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ltn1Q6A009 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ltn1Q6A009 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ltn1Q6A009 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ltn1Q6A009 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ltn1Q6A009 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ltn1Q6A009 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ltn1Q6A009 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Ltn1Q6A009 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ltn1Q6A009 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ltn1Q6A009 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ltn1Q6A009 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ltn1Q6A009 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ltn1Q6A009 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Ltn1Q6A009 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ltn1Q6A009 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ltn1Q6A009 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ltn1Q6A009 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ltn1Q6A009 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ltn1Q6A009 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ltn1Q6A009 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ltn1Q6A009 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ltn1Q6A009 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ltn1Q6A009 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Ltn1Q6A009 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ltn1Q6A009 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ltn1Q6A009 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ltn1Q6A009 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ltn1Q6A009 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ltn1Q6A009 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ltn1Q6A009 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ltn1Q6A009 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ltn1Q6A009 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ltn1Q6A009 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ltn1Q6A009 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ltn1Q6A009 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ltn1Q6A009 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Ltn1Q6A009 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ltn1Q6A009 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ltn1Q6A009 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Ltn1Q6A009 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Ltn1Q6A009 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ltn1Q6A009 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ltn1Q6A009 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ltn1Q6A009 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ltn1Q6A009 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ltn1Q6A009 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ltn1Q6A009 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ltn1Q6A009 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ltn1Q6A009 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ltn1Q6A009 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ltn1Q6A009 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ltn1Q6A009 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ltn1Q6A009 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ltn1Q6A009 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Ltn1Q6A009 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ltn1Q6A009 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ltn1Q6A009 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ltn1Q6A009 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
Ltn1Q6A009 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Ltn1Q6A009 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Ltn1Q6A009 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Ltn1Q6A009 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ltn1Q6A009 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ltn1Q6A009 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ltn1Q6A009 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ltn1Q6A009 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ltn1Q6A009 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ltn1Q6A009 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ltn1Q6A009 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ltn1Q6A009 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ltn1Q6A009 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ltn1Q6A009 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ltn1Q6A009 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms