Protein–RNA interactions for Protein: Q68FD5

Cltc, Clathrin heavy chain 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,675 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltcQ68FD5 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CltcQ68FD5 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CltcQ68FD5 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CltcQ68FD5 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CltcQ68FD5 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CltcQ68FD5 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CltcQ68FD5 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
CltcQ68FD5 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
CltcQ68FD5 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
CltcQ68FD5 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CltcQ68FD5 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CltcQ68FD5 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CltcQ68FD5 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CltcQ68FD5 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CltcQ68FD5 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CltcQ68FD5 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CltcQ68FD5 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CltcQ68FD5 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CltcQ68FD5 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CltcQ68FD5 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CltcQ68FD5 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CltcQ68FD5 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CltcQ68FD5 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CltcQ68FD5 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CltcQ68FD5 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
CltcQ68FD5 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CltcQ68FD5 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CltcQ68FD5 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CltcQ68FD5 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CltcQ68FD5 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CltcQ68FD5 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
CltcQ68FD5 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CltcQ68FD5 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CltcQ68FD5 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CltcQ68FD5 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CltcQ68FD5 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CltcQ68FD5 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CltcQ68FD5 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CltcQ68FD5 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CltcQ68FD5 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
CltcQ68FD5 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CltcQ68FD5 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CltcQ68FD5 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CltcQ68FD5 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CltcQ68FD5 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CltcQ68FD5 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CltcQ68FD5 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
CltcQ68FD5 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CltcQ68FD5 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CltcQ68FD5 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CltcQ68FD5 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CltcQ68FD5 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CltcQ68FD5 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CltcQ68FD5 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
CltcQ68FD5 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
CltcQ68FD5 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CltcQ68FD5 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CltcQ68FD5 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
CltcQ68FD5 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CltcQ68FD5 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CltcQ68FD5 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CltcQ68FD5 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CltcQ68FD5 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CltcQ68FD5 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CltcQ68FD5 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CltcQ68FD5 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
CltcQ68FD5 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CltcQ68FD5 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CltcQ68FD5 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CltcQ68FD5 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CltcQ68FD5 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CltcQ68FD5 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
CltcQ68FD5 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CltcQ68FD5 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CltcQ68FD5 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CltcQ68FD5 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CltcQ68FD5 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CltcQ68FD5 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CltcQ68FD5 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CltcQ68FD5 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CltcQ68FD5 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CltcQ68FD5 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CltcQ68FD5 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CltcQ68FD5 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CltcQ68FD5 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CltcQ68FD5 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CltcQ68FD5 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CltcQ68FD5 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CltcQ68FD5 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CltcQ68FD5 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CltcQ68FD5 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CltcQ68FD5 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CltcQ68FD5 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CltcQ68FD5 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
CltcQ68FD5 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
CltcQ68FD5 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CltcQ68FD5 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CltcQ68FD5 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CltcQ68FD5 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CltcQ68FD5 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms