Protein–RNA interactions for Protein: Q62361

Trh, Pro-thyrotropin-releasing hormone, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrhQ62361 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TrhQ62361 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TrhQ62361 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TrhQ62361 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TrhQ62361 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TrhQ62361 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TrhQ62361 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TrhQ62361 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TrhQ62361 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TrhQ62361 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TrhQ62361 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TrhQ62361 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TrhQ62361 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TrhQ62361 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TrhQ62361 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TrhQ62361 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TrhQ62361 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TrhQ62361 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TrhQ62361 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TrhQ62361 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TrhQ62361 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TrhQ62361 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TrhQ62361 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
TrhQ62361 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TrhQ62361 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TrhQ62361 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TrhQ62361 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TrhQ62361 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TrhQ62361 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TrhQ62361 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TrhQ62361 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TrhQ62361 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TrhQ62361 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TrhQ62361 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TrhQ62361 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TrhQ62361 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TrhQ62361 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TrhQ62361 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TrhQ62361 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TrhQ62361 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TrhQ62361 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TrhQ62361 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TrhQ62361 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TrhQ62361 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TrhQ62361 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TrhQ62361 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TrhQ62361 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TrhQ62361 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TrhQ62361 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TrhQ62361 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TrhQ62361 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TrhQ62361 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TrhQ62361 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TrhQ62361 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TrhQ62361 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TrhQ62361 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TrhQ62361 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TrhQ62361 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TrhQ62361 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TrhQ62361 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TrhQ62361 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TrhQ62361 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TrhQ62361 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TrhQ62361 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TrhQ62361 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TrhQ62361 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TrhQ62361 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TrhQ62361 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TrhQ62361 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TrhQ62361 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TrhQ62361 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TrhQ62361 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TrhQ62361 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TrhQ62361 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TrhQ62361 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TrhQ62361 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TrhQ62361 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TrhQ62361 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TrhQ62361 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TrhQ62361 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TrhQ62361 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TrhQ62361 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TrhQ62361 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TrhQ62361 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TrhQ62361 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TrhQ62361 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TrhQ62361 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TrhQ62361 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TrhQ62361 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TrhQ62361 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TrhQ62361 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TrhQ62361 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TrhQ62361 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TrhQ62361 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TrhQ62361 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TrhQ62361 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TrhQ62361 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TrhQ62361 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TrhQ62361 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TrhQ62361 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms