Protein–RNA interactions for Protein: Q62311

Taf6, Transcription initiation factor TFIID subunit 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf6Q62311 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Taf6Q62311 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Taf6Q62311 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Taf6Q62311 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Taf6Q62311 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Taf6Q62311 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Taf6Q62311 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Taf6Q62311 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Taf6Q62311 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Taf6Q62311 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Taf6Q62311 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Taf6Q62311 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Taf6Q62311 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Taf6Q62311 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Taf6Q62311 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Taf6Q62311 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Taf6Q62311 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Taf6Q62311 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Taf6Q62311 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Taf6Q62311 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Taf6Q62311 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Taf6Q62311 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Taf6Q62311 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Taf6Q62311 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Taf6Q62311 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Taf6Q62311 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Taf6Q62311 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Taf6Q62311 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Taf6Q62311 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Taf6Q62311 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Taf6Q62311 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Taf6Q62311 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Taf6Q62311 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Taf6Q62311 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Taf6Q62311 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Taf6Q62311 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Taf6Q62311 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Taf6Q62311 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Taf6Q62311 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Taf6Q62311 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Taf6Q62311 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Taf6Q62311 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Taf6Q62311 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Taf6Q62311 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Taf6Q62311 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Taf6Q62311 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Taf6Q62311 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Taf6Q62311 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Taf6Q62311 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Taf6Q62311 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Taf6Q62311 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Taf6Q62311 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Taf6Q62311 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Taf6Q62311 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Taf6Q62311 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Taf6Q62311 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Taf6Q62311 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Taf6Q62311 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Taf6Q62311 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Taf6Q62311 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Taf6Q62311 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Taf6Q62311 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Taf6Q62311 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Taf6Q62311 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Taf6Q62311 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Taf6Q62311 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Taf6Q62311 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Taf6Q62311 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Taf6Q62311 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Taf6Q62311 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Taf6Q62311 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Taf6Q62311 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Taf6Q62311 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Taf6Q62311 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Taf6Q62311 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Taf6Q62311 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Taf6Q62311 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Taf6Q62311 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Taf6Q62311 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Taf6Q62311 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Taf6Q62311 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Taf6Q62311 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Taf6Q62311 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Taf6Q62311 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Taf6Q62311 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Taf6Q62311 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Taf6Q62311 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Taf6Q62311 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Taf6Q62311 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Taf6Q62311 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Taf6Q62311 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Taf6Q62311 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Taf6Q62311 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Taf6Q62311 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Taf6Q62311 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Taf6Q62311 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Taf6Q62311 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Taf6Q62311 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Taf6Q62311 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Taf6Q62311 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms