Protein–RNA interactions for Protein: Q62280

Ss18, Protein SSXT, mousemouse

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Length 418 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ss18Q62280 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ss18Q62280 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ss18Q62280 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ss18Q62280 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ss18Q62280 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ss18Q62280 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ss18Q62280 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ss18Q62280 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Ss18Q62280 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ss18Q62280 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ss18Q62280 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ss18Q62280 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ss18Q62280 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ss18Q62280 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ss18Q62280 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Ss18Q62280 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ss18Q62280 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ss18Q62280 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ss18Q62280 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ss18Q62280 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ss18Q62280 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ss18Q62280 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ss18Q62280 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ss18Q62280 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ss18Q62280 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ss18Q62280 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ss18Q62280 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ss18Q62280 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ss18Q62280 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ss18Q62280 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ss18Q62280 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ss18Q62280 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ss18Q62280 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Ss18Q62280 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Ss18Q62280 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ss18Q62280 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Ss18Q62280 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ss18Q62280 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ss18Q62280 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ss18Q62280 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ss18Q62280 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ss18Q62280 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ss18Q62280 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ss18Q62280 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ss18Q62280 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ss18Q62280 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ss18Q62280 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ss18Q62280 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ss18Q62280 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ss18Q62280 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ss18Q62280 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ss18Q62280 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ss18Q62280 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ss18Q62280 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ss18Q62280 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ss18Q62280 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ss18Q62280 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ss18Q62280 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ss18Q62280 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ss18Q62280 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ss18Q62280 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ss18Q62280 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ss18Q62280 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ss18Q62280 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ss18Q62280 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ss18Q62280 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ss18Q62280 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ss18Q62280 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ss18Q62280 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ss18Q62280 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ss18Q62280 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ss18Q62280 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ss18Q62280 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ss18Q62280 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Ss18Q62280 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ss18Q62280 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ss18Q62280 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ss18Q62280 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ss18Q62280 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ss18Q62280 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ss18Q62280 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ss18Q62280 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ss18Q62280 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ss18Q62280 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ss18Q62280 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ss18Q62280 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ss18Q62280 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ss18Q62280 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ss18Q62280 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ss18Q62280 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ss18Q62280 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ss18Q62280 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ss18Q62280 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ss18Q62280 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ss18Q62280 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ss18Q62280 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Ss18Q62280 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ss18Q62280 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ss18Q62280 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ss18Q62280 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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