Protein–RNA interactions for Protein: Q61878

Prg2, Bone marrow proteoglycan, mousemouse

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prg2Q61878 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Prg2Q61878 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Prg2Q61878 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Prg2Q61878 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Prg2Q61878 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Prg2Q61878 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Prg2Q61878 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Prg2Q61878 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Prg2Q61878 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Prg2Q61878 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Prg2Q61878 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Prg2Q61878 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Prg2Q61878 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Prg2Q61878 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Prg2Q61878 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Prg2Q61878 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Prg2Q61878 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Prg2Q61878 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Prg2Q61878 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Prg2Q61878 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Prg2Q61878 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Prg2Q61878 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Prg2Q61878 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Prg2Q61878 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Prg2Q61878 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Prg2Q61878 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Prg2Q61878 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Prg2Q61878 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Prg2Q61878 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Prg2Q61878 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Prg2Q61878 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Prg2Q61878 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Prg2Q61878 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Prg2Q61878 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Prg2Q61878 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Prg2Q61878 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Prg2Q61878 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Prg2Q61878 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Prg2Q61878 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Prg2Q61878 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Prg2Q61878 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Prg2Q61878 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Prg2Q61878 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Prg2Q61878 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Prg2Q61878 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Prg2Q61878 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Prg2Q61878 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Prg2Q61878 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Prg2Q61878 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Prg2Q61878 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Prg2Q61878 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Prg2Q61878 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Prg2Q61878 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Prg2Q61878 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Prg2Q61878 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Prg2Q61878 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Prg2Q61878 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Prg2Q61878 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Prg2Q61878 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Prg2Q61878 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Prg2Q61878 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Prg2Q61878 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Prg2Q61878 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Prg2Q61878 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Prg2Q61878 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Prg2Q61878 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Prg2Q61878 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
Prg2Q61878 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Prg2Q61878 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Prg2Q61878 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Prg2Q61878 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Prg2Q61878 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Prg2Q61878 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Prg2Q61878 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Prg2Q61878 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Prg2Q61878 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Prg2Q61878 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Prg2Q61878 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Prg2Q61878 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Prg2Q61878 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Prg2Q61878 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Prg2Q61878 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Prg2Q61878 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Prg2Q61878 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Prg2Q61878 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Prg2Q61878 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Prg2Q61878 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Prg2Q61878 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Prg2Q61878 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Prg2Q61878 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Prg2Q61878 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Prg2Q61878 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Prg2Q61878 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Prg2Q61878 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Prg2Q61878 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Prg2Q61878 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Prg2Q61878 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Prg2Q61878 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Prg2Q61878 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Prg2Q61878 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms