Protein–RNA interactions for Protein: Q61043

Nin, Ninein, mousemouse

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Length 2,035 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NinQ61043 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NinQ61043 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NinQ61043 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NinQ61043 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NinQ61043 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NinQ61043 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NinQ61043 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NinQ61043 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NinQ61043 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NinQ61043 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NinQ61043 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NinQ61043 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NinQ61043 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NinQ61043 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NinQ61043 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NinQ61043 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NinQ61043 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NinQ61043 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NinQ61043 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NinQ61043 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NinQ61043 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NinQ61043 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NinQ61043 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
NinQ61043 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NinQ61043 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NinQ61043 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NinQ61043 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NinQ61043 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NinQ61043 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NinQ61043 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NinQ61043 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NinQ61043 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NinQ61043 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NinQ61043 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NinQ61043 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NinQ61043 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NinQ61043 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NinQ61043 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
NinQ61043 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NinQ61043 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NinQ61043 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NinQ61043 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NinQ61043 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NinQ61043 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NinQ61043 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NinQ61043 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
NinQ61043 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
NinQ61043 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NinQ61043 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NinQ61043 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NinQ61043 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NinQ61043 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NinQ61043 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NinQ61043 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NinQ61043 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NinQ61043 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NinQ61043 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NinQ61043 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
NinQ61043 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NinQ61043 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NinQ61043 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NinQ61043 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
NinQ61043 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NinQ61043 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NinQ61043 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NinQ61043 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NinQ61043 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NinQ61043 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NinQ61043 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NinQ61043 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NinQ61043 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NinQ61043 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NinQ61043 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NinQ61043 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NinQ61043 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NinQ61043 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NinQ61043 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NinQ61043 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NinQ61043 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NinQ61043 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NinQ61043 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NinQ61043 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
NinQ61043 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NinQ61043 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NinQ61043 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NinQ61043 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NinQ61043 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NinQ61043 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
NinQ61043 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NinQ61043 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NinQ61043 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
NinQ61043 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NinQ61043 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NinQ61043 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NinQ61043 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NinQ61043 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NinQ61043 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
NinQ61043 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NinQ61043 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NinQ61043 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms