Protein–RNA interactions for Protein: Q60972

Rbbp4, Histone-binding protein RBBP4, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp4Q60972 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rbbp4Q60972 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rbbp4Q60972 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rbbp4Q60972 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rbbp4Q60972 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rbbp4Q60972 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rbbp4Q60972 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rbbp4Q60972 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Rbbp4Q60972 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Rbbp4Q60972 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rbbp4Q60972 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rbbp4Q60972 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rbbp4Q60972 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rbbp4Q60972 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rbbp4Q60972 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rbbp4Q60972 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rbbp4Q60972 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rbbp4Q60972 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rbbp4Q60972 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rbbp4Q60972 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rbbp4Q60972 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rbbp4Q60972 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rbbp4Q60972 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rbbp4Q60972 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rbbp4Q60972 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rbbp4Q60972 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Rbbp4Q60972 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rbbp4Q60972 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rbbp4Q60972 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rbbp4Q60972 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rbbp4Q60972 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rbbp4Q60972 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rbbp4Q60972 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Rbbp4Q60972 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rbbp4Q60972 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rbbp4Q60972 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rbbp4Q60972 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rbbp4Q60972 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rbbp4Q60972 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rbbp4Q60972 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rbbp4Q60972 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rbbp4Q60972 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rbbp4Q60972 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rbbp4Q60972 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Rbbp4Q60972 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rbbp4Q60972 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rbbp4Q60972 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rbbp4Q60972 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rbbp4Q60972 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rbbp4Q60972 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rbbp4Q60972 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rbbp4Q60972 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Rbbp4Q60972 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rbbp4Q60972 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rbbp4Q60972 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Rbbp4Q60972 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rbbp4Q60972 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rbbp4Q60972 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rbbp4Q60972 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rbbp4Q60972 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rbbp4Q60972 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rbbp4Q60972 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rbbp4Q60972 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Rbbp4Q60972 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rbbp4Q60972 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rbbp4Q60972 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rbbp4Q60972 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rbbp4Q60972 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rbbp4Q60972 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rbbp4Q60972 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rbbp4Q60972 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rbbp4Q60972 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rbbp4Q60972 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rbbp4Q60972 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rbbp4Q60972 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rbbp4Q60972 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rbbp4Q60972 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rbbp4Q60972 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rbbp4Q60972 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rbbp4Q60972 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rbbp4Q60972 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rbbp4Q60972 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rbbp4Q60972 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rbbp4Q60972 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rbbp4Q60972 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rbbp4Q60972 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rbbp4Q60972 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rbbp4Q60972 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rbbp4Q60972 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rbbp4Q60972 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rbbp4Q60972 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rbbp4Q60972 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rbbp4Q60972 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rbbp4Q60972 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rbbp4Q60972 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rbbp4Q60972 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rbbp4Q60972 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Rbbp4Q60972 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Rbbp4Q60972 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rbbp4Q60972 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 100.7 ms