Protein–RNA interactions for Protein: Q60829

Ppp1r1b, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 1B, mousemouse

Predictions only

Length 194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp1r1bQ60829 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ppp1r1bQ60829 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ppp1r1bQ60829 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Ppp1r1bQ60829 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ppp1r1bQ60829 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ppp1r1bQ60829 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ppp1r1bQ60829 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ppp1r1bQ60829 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ppp1r1bQ60829 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ppp1r1bQ60829 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ppp1r1bQ60829 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ppp1r1bQ60829 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ppp1r1bQ60829 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ppp1r1bQ60829 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ppp1r1bQ60829 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ppp1r1bQ60829 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ppp1r1bQ60829 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Ppp1r1bQ60829 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ppp1r1bQ60829 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ppp1r1bQ60829 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ppp1r1bQ60829 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ppp1r1bQ60829 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ppp1r1bQ60829 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ppp1r1bQ60829 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Ppp1r1bQ60829 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Ppp1r1bQ60829 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ppp1r1bQ60829 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ppp1r1bQ60829 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ppp1r1bQ60829 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ppp1r1bQ60829 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ppp1r1bQ60829 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ppp1r1bQ60829 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ppp1r1bQ60829 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Ppp1r1bQ60829 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ppp1r1bQ60829 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ppp1r1bQ60829 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ppp1r1bQ60829 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ppp1r1bQ60829 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ppp1r1bQ60829 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ppp1r1bQ60829 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ppp1r1bQ60829 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ppp1r1bQ60829 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ppp1r1bQ60829 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ppp1r1bQ60829 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ppp1r1bQ60829 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ppp1r1bQ60829 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Ppp1r1bQ60829 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ppp1r1bQ60829 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ppp1r1bQ60829 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ppp1r1bQ60829 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ppp1r1bQ60829 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ppp1r1bQ60829 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ppp1r1bQ60829 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ppp1r1bQ60829 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ppp1r1bQ60829 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ppp1r1bQ60829 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Ppp1r1bQ60829 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Ppp1r1bQ60829 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ppp1r1bQ60829 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ppp1r1bQ60829 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ppp1r1bQ60829 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ppp1r1bQ60829 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ppp1r1bQ60829 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ppp1r1bQ60829 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ppp1r1bQ60829 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ppp1r1bQ60829 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ppp1r1bQ60829 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ppp1r1bQ60829 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ppp1r1bQ60829 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ppp1r1bQ60829 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ppp1r1bQ60829 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ppp1r1bQ60829 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ppp1r1bQ60829 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ppp1r1bQ60829 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ppp1r1bQ60829 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ppp1r1bQ60829 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ppp1r1bQ60829 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ppp1r1bQ60829 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Ppp1r1bQ60829 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ppp1r1bQ60829 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ppp1r1bQ60829 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ppp1r1bQ60829 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Ppp1r1bQ60829 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Ppp1r1bQ60829 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ppp1r1bQ60829 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ppp1r1bQ60829 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Ppp1r1bQ60829 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ppp1r1bQ60829 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ppp1r1bQ60829 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Ppp1r1bQ60829 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ppp1r1bQ60829 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Ppp1r1bQ60829 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Ppp1r1bQ60829 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ppp1r1bQ60829 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ppp1r1bQ60829 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ppp1r1bQ60829 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ppp1r1bQ60829 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ppp1r1bQ60829 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ppp1r1bQ60829 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ppp1r1bQ60829 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms