Protein–RNA interactions for Protein: Q60710

Samhd1, Deoxynucleoside triphosphate triphosphohydrolase SAMHD1, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samhd1Q60710 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Samhd1Q60710 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Samhd1Q60710 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Samhd1Q60710 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Samhd1Q60710 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Samhd1Q60710 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Samhd1Q60710 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Samhd1Q60710 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Samhd1Q60710 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Samhd1Q60710 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Samhd1Q60710 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Samhd1Q60710 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Samhd1Q60710 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Samhd1Q60710 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Samhd1Q60710 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Samhd1Q60710 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Samhd1Q60710 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Samhd1Q60710 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Samhd1Q60710 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Samhd1Q60710 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Samhd1Q60710 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Samhd1Q60710 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Samhd1Q60710 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Samhd1Q60710 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Samhd1Q60710 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Samhd1Q60710 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Samhd1Q60710 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Samhd1Q60710 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Samhd1Q60710 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Samhd1Q60710 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Samhd1Q60710 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Samhd1Q60710 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Samhd1Q60710 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Samhd1Q60710 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Samhd1Q60710 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Samhd1Q60710 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Samhd1Q60710 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Samhd1Q60710 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Samhd1Q60710 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Samhd1Q60710 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Samhd1Q60710 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Samhd1Q60710 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Samhd1Q60710 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Samhd1Q60710 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Samhd1Q60710 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Samhd1Q60710 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Samhd1Q60710 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Samhd1Q60710 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Samhd1Q60710 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Samhd1Q60710 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Samhd1Q60710 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Samhd1Q60710 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Samhd1Q60710 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Samhd1Q60710 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Samhd1Q60710 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Samhd1Q60710 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Samhd1Q60710 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Samhd1Q60710 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Samhd1Q60710 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Samhd1Q60710 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Samhd1Q60710 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Samhd1Q60710 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Samhd1Q60710 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Samhd1Q60710 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Samhd1Q60710 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Samhd1Q60710 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Samhd1Q60710 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Samhd1Q60710 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Samhd1Q60710 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Samhd1Q60710 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Samhd1Q60710 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Samhd1Q60710 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Samhd1Q60710 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Samhd1Q60710 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Samhd1Q60710 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Samhd1Q60710 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Samhd1Q60710 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Samhd1Q60710 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Samhd1Q60710 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Samhd1Q60710 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Samhd1Q60710 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Samhd1Q60710 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Samhd1Q60710 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Samhd1Q60710 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Samhd1Q60710 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Samhd1Q60710 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Samhd1Q60710 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Samhd1Q60710 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Samhd1Q60710 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Samhd1Q60710 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Samhd1Q60710 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Samhd1Q60710 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Samhd1Q60710 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Samhd1Q60710 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Samhd1Q60710 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Samhd1Q60710 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Samhd1Q60710 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Samhd1Q60710 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Samhd1Q60710 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Samhd1Q60710 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms