Protein–RNA interactions for Protein: Q60696

Pmel, Melanocyte protein PMEL, mousemouse

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PmelQ60696 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PmelQ60696 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PmelQ60696 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PmelQ60696 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PmelQ60696 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PmelQ60696 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PmelQ60696 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PmelQ60696 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
PmelQ60696 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PmelQ60696 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PmelQ60696 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PmelQ60696 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PmelQ60696 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PmelQ60696 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PmelQ60696 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PmelQ60696 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PmelQ60696 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PmelQ60696 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PmelQ60696 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
PmelQ60696 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PmelQ60696 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
PmelQ60696 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PmelQ60696 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PmelQ60696 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PmelQ60696 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PmelQ60696 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PmelQ60696 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PmelQ60696 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PmelQ60696 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
PmelQ60696 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PmelQ60696 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PmelQ60696 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PmelQ60696 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PmelQ60696 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PmelQ60696 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PmelQ60696 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PmelQ60696 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PmelQ60696 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PmelQ60696 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PmelQ60696 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PmelQ60696 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PmelQ60696 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PmelQ60696 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PmelQ60696 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PmelQ60696 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PmelQ60696 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PmelQ60696 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PmelQ60696 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PmelQ60696 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PmelQ60696 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PmelQ60696 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PmelQ60696 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PmelQ60696 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
PmelQ60696 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PmelQ60696 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PmelQ60696 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PmelQ60696 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PmelQ60696 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PmelQ60696 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PmelQ60696 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PmelQ60696 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PmelQ60696 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PmelQ60696 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PmelQ60696 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PmelQ60696 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PmelQ60696 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PmelQ60696 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PmelQ60696 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PmelQ60696 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PmelQ60696 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PmelQ60696 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PmelQ60696 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PmelQ60696 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
PmelQ60696 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PmelQ60696 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PmelQ60696 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PmelQ60696 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PmelQ60696 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PmelQ60696 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PmelQ60696 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PmelQ60696 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PmelQ60696 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PmelQ60696 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PmelQ60696 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
PmelQ60696 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PmelQ60696 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PmelQ60696 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PmelQ60696 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PmelQ60696 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PmelQ60696 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PmelQ60696 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PmelQ60696 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PmelQ60696 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PmelQ60696 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PmelQ60696 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
PmelQ60696 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PmelQ60696 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PmelQ60696 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PmelQ60696 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PmelQ60696 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms