Protein–RNA interactions for Protein: Q60670

Sik1, Serine/threonine-protein kinase SIK1, mousemouse

Predictions only

Length 779 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sik1Q60670 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sik1Q60670 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sik1Q60670 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sik1Q60670 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sik1Q60670 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sik1Q60670 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sik1Q60670 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sik1Q60670 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Sik1Q60670 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sik1Q60670 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sik1Q60670 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sik1Q60670 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sik1Q60670 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sik1Q60670 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sik1Q60670 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sik1Q60670 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sik1Q60670 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sik1Q60670 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sik1Q60670 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sik1Q60670 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Sik1Q60670 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sik1Q60670 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sik1Q60670 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sik1Q60670 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sik1Q60670 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sik1Q60670 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sik1Q60670 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Sik1Q60670 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Sik1Q60670 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sik1Q60670 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sik1Q60670 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Sik1Q60670 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sik1Q60670 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sik1Q60670 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sik1Q60670 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sik1Q60670 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sik1Q60670 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sik1Q60670 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sik1Q60670 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sik1Q60670 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sik1Q60670 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Sik1Q60670 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sik1Q60670 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sik1Q60670 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sik1Q60670 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sik1Q60670 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sik1Q60670 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Sik1Q60670 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Sik1Q60670 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Sik1Q60670 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Sik1Q60670 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Sik1Q60670 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Sik1Q60670 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Sik1Q60670 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
Sik1Q60670 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sik1Q60670 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sik1Q60670 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sik1Q60670 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sik1Q60670 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sik1Q60670 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sik1Q60670 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sik1Q60670 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sik1Q60670 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sik1Q60670 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sik1Q60670 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Sik1Q60670 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sik1Q60670 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sik1Q60670 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sik1Q60670 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sik1Q60670 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sik1Q60670 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sik1Q60670 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sik1Q60670 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Sik1Q60670 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sik1Q60670 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sik1Q60670 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sik1Q60670 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sik1Q60670 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sik1Q60670 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sik1Q60670 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sik1Q60670 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sik1Q60670 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sik1Q60670 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sik1Q60670 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sik1Q60670 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sik1Q60670 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sik1Q60670 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sik1Q60670 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sik1Q60670 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sik1Q60670 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sik1Q60670 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sik1Q60670 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sik1Q60670 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Sik1Q60670 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sik1Q60670 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sik1Q60670 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sik1Q60670 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sik1Q60670 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sik1Q60670 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sik1Q60670 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58 ms